KLF5 (KLF transcription factor 5)

symbol:
KLF5
locus group:
protein-coding gene
location:
13q22.1
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type|Kruppel-like transcription factors
alias symbol:
IKLF|CKLF
alias name:
intestinal Kruppel-like factor
entrez id:
688
ensembl gene id:
ENSG00000102554
ucsc gene id:
uc001vje.4
refseq accession:
NM_001286818
hgnc_id:
HGNC:6349
approved reserved:
2000-03-06
13q22.1
基因染色体位置图

KLF5(Krüppel样因子5)属于KLF(Krüppel样因子)基因家族,该家族由17个成员组成,均含有高度保守的锌指结构域,能够结合DNA调控基因表达。KLF家族成员广泛参与细胞增殖、分化、凋亡及胚胎发育等生物学过程。KLF5主要在肠道、皮肤、血管平滑肌等组织中表达,其功能具有组织特异性。KLF5作为转录因子,可激活或抑制下游靶基因,参与Wnt/β-catenin、TGF-β等信号通路,调控细胞周期进程(如促进Cyclin D1表达)和上皮间质转化(EMT)。在肠道干细胞中,KLF5维持其自我更新能力;在血管系统中,它促进平滑肌细胞增殖与血管重塑。KLF5的突变或表达异常与多种疾病相关。例如,在癌症中,KLF5可能发挥促癌或抑癌的双重作用:在结直肠癌、乳腺癌中常过表达,促进肿瘤生长和转移;而在前列腺癌中可能起抑癌作用。KLF5基因扩增或启动子区突变可导致其过表达,与患者预后不良相关。相反,KLF5低表达可能影响肠道黏膜屏障功能,增加炎症性肠病风险。在心血管领域,KLF5过表达会加速动脉粥样硬化进程,而敲除后可减轻血管损伤后的狭窄。KLF5还参与代谢调控,其表达异常与胰岛素抵抗相关。该基因与家族其他成员(如KLF4)存在功能冗余或拮抗,例如KLF4通常抑制增殖而KLF5促进增殖,二者平衡对组织稳态至关重要。实验模型中,条件性敲除小鼠显示肠道隐窝结构破坏,而过表达转基因小鼠易发生上皮增生。药物开发中,KLF5被视为潜在靶点,小分子抑制剂在肿瘤模型中有一定疗效。

This gene encodes a member of the Kruppel-like factor subfamily of zinc finger proteins. The encoded protein is a transcriptional activator that binds directly to a specific recognition motif in the promoters of target genes. This protein acts downstream of multiple different signaling pathways and is regulated by post-translational modification. It may participate in both promoting and suppressing cell proliferation. Expression of this gene may be changed in a variety of different cancers and in cardiovascular disease. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2013]

这个基因编码锌指蛋白的Kruppel样因子亚家族的一个成员。所编码的蛋白质是一个直接结合到靶基因的启动子的特异性识别基序的转录激活。该蛋白质作用的多个不同的信号通路的下游,并且通过翻译后修饰调节。它可以同时参加促进和抑制细胞增殖。可以以各种不同的癌症和心血管疾病可以改变这个基因的表达。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2013年11月提供]

KLF5基因的碱基序列:[NCBI]
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KLF5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1051343       rs1109940       rs1109941       rs3168743       rs3782933       rs3812852       rs4885061       rs4885062       rs4885063       rs4885064       rs4885065       rs5804655       rs7331797       rs7490589       rs7987646       rs7987694       rs7987720      

KLF5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCCACTACTGCGATTACCC
59
GTGTGAGTCCTCAGGTGAG
59
CTACTGCGATTACCCTGGT
59
CAGTGTGAGTCCTCAGGTG
60
TGTGAAGTTATCAGTACCAGAC
58
CCCAGGTACACTTGTATGG
57
GCCTATAACTTGGTTCCAGG
58
CTTCTCCATTTCACATCTTGTC
58
CTGGTCCAGACAAGATGTG
58
AGAACTGGTCTACGACTGAG
59
GACTCACATGATGAGAGCG
58
ACATCTTGTCTTGGTGTGG
58
CTATAACTTGGTTCCAGGCA
57
AGGTGTCAGATACTTCTCCA
58
CCTATAACTTGGTTCCAGGC
58
CTTCTCCATTTCACATCTTGTC
58
ACTCACATGATGAGAGCGT
59
CACATCTTGTCTTGGTGTGG
59
ACTACTGCGATTACCCTGG
59
GTGTGAGTCCTCAGGTGAG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
AR
KLF5
Unknown
KLF5
BIRC5
Activation
KLF5
CCNB1
Activation
KLF5
CCND1
Activation
KLF5
CDKN2B
Unknown
KLF5
CXCR4
Activation
KLF5
FASN
Activation
KLF5
FGFBP1
Activation
KLF5
FOXO1
Unknown
KLF5
HIF1A
Activation

KLF5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KLF5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q13887 (UniProtKB)
IEA
GO:0000978
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0001077
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0001525
Q13887 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q13887 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0006366
Q13887 (UniProtKB)
TAS
GO:0030033
Q13887 (UniProtKB)
IEA
GO:0032534
Q13887 (UniProtKB)
IEA
GO:0035914
Q13887 (UniProtKB)
IEA
GO:0043231
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0045600
Q13887 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q13887 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q13887 (UniProtKB)
IEA
GO:0060576
Q13887 (UniProtKB)
IEA

可能调控 KLF5基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pancreatic Neoplasm 0.12 1 0 CTD_human
Neointima 0.12 1 0 CTD_human
Vascular Diseases 0.08 1 0 RGD
Graft Occlusion, Vascular 0.08 1 0 RGD
Prostatic Neoplasms 0.005991584 4 0 BeFree_LHGDN
Schizophrenia 0.005362824 1 0 BeFree_GAD_LHGDN
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.005005506 2 0 BeFree_GAD
Carcinogenesis 0.004071628 15 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.003181358 4 1 BeFree_GAD
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN

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