KDM5B (lysine demethylase 5B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
KDM5B
locus group:
protein-coding gene
location:
1q32.1
gene_family:
PHD finger proteins|Lysine (K)-specific demethylases
alias symbol:
RBBP2H1A|PLU-1|CT31|PPP1R98
alias name:
cancer/testis antigen 31|protein p…
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10765
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ENSG00000117139
ucsc gene id:
uc001gyf.4
refseq accession:
NM_006618
hgnc_id:
HGNC:18039
approved reserved:
2004-01-28

基因染色体位置

基因染色体位置

1q32.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

KDM5B（也称为JARID1B或PLU-1）是一种组蛋白去甲基化酶，属于KDM5基因家族。该家族成员（包括KDM5A、KDM5B、KDM5C和KDM5D）的共同特点是能够特异性去除组蛋白H3第4位赖氨酸（H3K4）上的甲基化标记，这种修饰通常与基因转录激活相关。KDM5B通过调控H3K4me3/me2的甲基化状态影响染色质结构和基因表达，在细胞分化、增殖和干细胞自我更新等生物学过程中发挥重要作用。KDM5B在多种组织中表达，尤其在睾丸、卵巢和胎盘等生殖组织中表达较高。研究表明KDM5B在胚胎发育中起关键作用，参与维持胚胎干细胞的干性。KDM5B的异常表达与多种疾病相关，特别是在癌症中表现突出。在乳腺癌、黑色素瘤、肺癌和前列腺癌等多种肿瘤中，KDM5B常出现过表达，这可能通过促进肿瘤干细胞特性、增强细胞增殖和抑制分化来驱动肿瘤发生发展。KDM5B的突变相对罕见，但某些突变可能导致其功能获得或丧失，影响其去甲基化酶活性或与其他蛋白的相互作用。KDM5B过表达通常与肿瘤恶性程度增加、治疗抵抗和不良预后相关，这可能与其维持肿瘤干细胞群体和促进上皮间质转化（EMT）的能力有关。相反，KDM5B表达降低可能导致分化异常和发育缺陷。KDM5B与其他表观遗传调控因子如Polycomb家族蛋白存在功能上的相互作用，共同调控基因表达程序。在药物开发方面，针对KDM5B的小分子抑制剂正在被研究作为潜在的抗癌治疗策略。此外，KDM5B还参与DNA损伤修复过程，这可能解释了其在维持基因组稳定性中的作用。值得注意的是，KDM5B的功能具有组织特异性和环境依赖性，在某些情况下可能表现出抑癌基因的特性。

None

无

OMIM数据库中对KDM5B基因的介绍     Wikipedia数据库中对KDM5B基因的介绍

基因序列

基因序列

KDM5B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

KDM5B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs12967       rs1141108       rs1141109       rs1892163       rs1892164       rs2275891       rs2275892       rs2275893       rs2275894       rs2275895       rs2362916       rs2363762       rs2363763       rs2363960       rs2363965       rs2885651       rs2885898      

基因表达

基因表达

KDM5B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGAATTGGAGTCCCGCTC
60
AATGACTTGAACCCAGGAGG
60
CTGAATGAATTGGAGGCCC
59
TACTTCCCTGTAACTCCCAG
58
CAAAGGAATTTGGCAGTGG
58
CACTATCAAGATACTCCTCTTCC
58
TAAATTGCGGTATAGGTACACG
59
TTCGTTGTAAGATTCTGCTCG
59
ACTGGGACAACAGAACCTC
59
CTGGACTAACACCATGGAGG
60
AATGAATTGGAGTCCCGCT
59
ATGACTTGAACCCAGGAGG
59
GAATTGGAGGCCCAAACTC
59
CAGAGTACTTCCCTGTAACTCC
60
AAATTGCGGTATAGGTACACG
59
TTCGTTGTAAGATTCTGCTCG
59
CTTTACTTGCAAAGCCAAGC
59
AACAGTCATTCTTCTCACTGC
59
TCAAAGGAATTTGGCAGTGG
59
ACTATCAAGATACTCCTCTTCCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

KDM5B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KDM5B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
B3KV94 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
B3KV94 (UniProtKB)
IDA
GO:0008270
B3KV94 (UniProtKB)
IEA
GO:0016706
B3KV94 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
B3KV94 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q9UGL1 (UniProtKB)
TAS
GO:0003714
Q9UGL1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q9UGL1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UGL1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UGL1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9UGL1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9UGL1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9UGL1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
Q9UGL1 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007338
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
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IEA
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Q9UGL1 (UniProtKB)
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IEA
GO:0032452
Q9UGL1 (UniProtKB)
TAS
GO:0032452
Q9UGL1 (UniProtKB)
TAS
GO:0032453
Q9UGL1 (UniProtKB)
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GO:0033601
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0034647
Q9UGL1 (UniProtKB)
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GO:0034648
Q9UGL1 (UniProtKB)
IDA
GO:0034720
Q9UGL1 (UniProtKB)
IDA
GO:0034721
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0044344
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0045892
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0048511
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060444
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060763
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060992
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0061038
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0070306
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA
GO:2000864
Q9UGL1 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 KDM5B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.002714419 10 0 BeFree
Hypertensive disease 0.002367032 1 0 GAD
melanoma 0.001628651 6 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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