ITGB3BP (integrin subunit beta 3 binding protein)

symbol:
ITGB3BP
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protein-coding gene
location:
1p31.3
gene_family:
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NRIF3|HSU37139|TAP20|CENPR
alias name:
centromere protein R|beta3-endonex…
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23421
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NM_014288
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HGNC:6157
approved reserved:
2000-05-08
1p31.3
基因染色体位置图

ITGB3BP(Integrin Beta 3 Binding Protein),也称为CENP-R或NRIF3,是一种与细胞黏附、信号传导和基因调控相关的多功能蛋白。它主要通过与整合素β3亚基结合参与细胞外基质与细胞骨架之间的连接,影响细胞迁移、增殖和存活。ITGB3BP在细胞核内也发挥作用,作为转录辅调节因子参与基因表达调控,特别是与核受体(如甲状腺激素受体和视黄酸受体)相互作用,影响细胞分化与代谢过程。该蛋白的典型作用位点包括细胞膜(通过整合素相互作用)和细胞核(通过DNA结合或转录复合物参与)。ITGB3BP的突变可能导致其与整合素或核受体的结合能力下降,进而破坏细胞黏附稳定性或基因表达调控,与肿瘤转移、心血管疾病和发育异常相关。例如,某些突变可能削弱其抑癌功能,促进癌细胞侵袭。ITGB3BP过表达可能增强细胞迁移能力,加剧肿瘤转移风险,同时可能通过异常激活核受体通路扰乱代谢平衡;而表达降低则可能导致细胞黏附缺陷,影响组织完整性或胚胎发育。ITGB3BP属于核受体相互作用因子(NRIF)家族,该家族成员共性包括:含有核定位信号,能够与核受体结合并调节其转录活性;参与细胞增殖、凋亡和分化的信号整合;部分成员(如ITGB3BP)还具有跨膜信号与核内基因调控的双重功能。此外,ITGB3BP与着丝粒蛋白CENP-R同源,暗示其可能在染色体稳定性中起作用。研究还发现,ITGB3BP通过调控VEGF等基因影响血管生成,与动脉粥样硬化或糖尿病血管病变相关。其表达水平在多种癌症(如乳腺癌、胶质瘤)中异常,可能成为预后标志物或治疗靶点。

This gene encodes a transcriptional coregulator that binds to and enhances the activity of members of the nuclear receptor families, thyroid hormone receptors and retinoid X receptors. This protein also acts as a corepressor of NF-kappaB-dependent signaling. This protein induces apoptosis in breast cancer cells through a caspase 2-mediated signaling pathway. This protein is also a component of the centromere-specific histone H3 variant nucleosome associated complex (CENP-NAC) and may be involved in mitotic progression by recruiting the histone H3 variant CENP-A to the centromere. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2011]

这个基因编码结合并增强核受体家族成员,甲状腺激素受体和视黄醇X受体的活性的转录coregulator。这种蛋白也作为NF-κB的依赖性信号的辅阻遏物。该蛋白质通过胱天蛋白酶2介导的信号传导途径诱导乳腺癌细胞的细胞凋亡。这种蛋白也是特定着丝粒组蛋白H3变体核小体相关的复合物(CENP-NAC)的一个组成部分,并且可以在有丝分裂进程通过招募组蛋白H3变体CENP-A至着丝点的参与。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2011年9月提供]

ITGB3BP基因的碱基序列:[NCBI]
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ITGB3BP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs217478       rs2474469       rs6588049       rs6672385       rs6684993       rs7413854       rs7525159       rs9436243       rs9436244       rs9436245       rs9436686       rs10561667       rs10687198       rs10889427       rs10889428       rs10889429       rs10889430      

ITGB3BP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAACAACAGTGTAAGAGGGT
58
ACAGACCATCCAACTTCAG
57
CATTGGAATCTCCTGTGCA
58
CTTCTTAATGCCTTTGTGAGG
57
AGTATACAGGCTTTGGAGGG
59
TTGTGAGGAAGTCCTGTACTC
59
CATATACTGTGGCAAGTTGC
57
GCATTTCTTCTTAATGCCTCAG
58
AGTATACAGGCTTTGGAGGG
58
TTGTGAGGAAGTCCTGTACTC
59
CTCCCACAAGTTCTGAAGAG
58
CTTTGCTTTCAGTTAAACTGGG
59
CAGAATGCCTCATTTGATCCT
59
TTGACAAGTTCCAGTTGTTGG
59
TCATTGGAATCTCCTGTGCA
60
TCTGAGGCTGACCTTTGTG
60
TCCTCACAAAGGCATTAAGG
58
TAACAGTCTCCTCTATGCAGG
59
CCGAATCTCAGAATGCCTG
58
CCTCAGATGTATTCTGAGGAGAG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
MTA1
ITGB3BP
Unknown

ITGB3BP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ITGB3BP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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Q13352 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ITGB3BP基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Endometriosis 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001357209 5 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree

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