IL1RN (interleukin 1 receptor antagonist)

symbol:
IL1RN
locus group:
protein-coding gene
location:
2q14.1
gene_family:
Endogenous ligands|Interleukins|Interleukin receptors
alias symbol:
IL1RA|ICIL-1RA|IL1F3|IRAP|IL-1RN|MGC10430
alias name:
interleukin-1 receptor antagonist …
entrez id:
3557
ensembl gene id:
ENSG00000136689
ucsc gene id:
uc002tjb.4
refseq accession:
NM_173841
hgnc_id:
HGNC:6000
approved reserved:
1990-11-20
2q14.1
基因染色体位置图

IL1RN(白细胞介素1受体拮抗剂)基因编码一种重要的抗炎蛋白IL-1Ra,属于白细胞介素1(IL-1)基因家族。该家族包括促炎因子IL-1α和IL-1β以及它们的拮抗剂IL-1Ra,主要参与免疫调节和炎症反应。IL1RN基因产物IL-1Ra通过与IL-1受体结合但不激活下游信号通路,竞争性抑制IL-1α和IL-1β的促炎作用,从而调节炎症反应。该基因主要在巨噬细胞、中性粒细胞和上皮细胞中表达,在炎症部位浓度显著升高。IL1RN基因突变可能导致IL-1Ra功能异常或产量不足,与多种自身免疫和炎症性疾病相关,如类风湿关节炎、炎症性肠病和银屑病等。IL1RN基因过表达可抑制过度炎症反应,具有潜在的治疗价值,临床试验显示重组IL-1Ra(阿那金拉)可有效治疗类风湿关节炎和某些自身炎症性疾病。相反,IL1RN表达降低可能导致IL-1信号通路过度激活,引发慢性炎症和组织损伤。值得注意的是,IL1RN基因存在多态性,某些变异与疾病易感性相关,如VNTR多态性与系统性红斑狼疮风险增加有关。IL-1家族成员的共同特点是都参与先天免疫反应调节,通过结合IL-1受体发挥作用,但各自功能不同:IL-1α和IL-1β促进炎症,而IL-1Ra则起抑制作用。

The protein encoded by this gene is a member of the interleukin 1 cytokine family. This protein inhibits the activities of interleukin 1, alpha (IL1A) and interleukin 1, beta (IL1B), and modulates a variety of interleukin 1 related immune and inflammatory responses. This gene and five other closely related cytokine genes form a gene cluster spanning approximately 400 kb on chromosome 2. A polymorphism of this gene is reported to be associated with increased risk of osteoporotic fractures and gastric cancer. Four alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是白细胞介素1的细胞因子家族的一个成员。这种蛋白质能抑制白细胞介素1,α(IL1A)和白细胞介素1,β(IL1B)的活动,并调节各种白细胞介素1相关的免疫和炎症反应。该基因与其他五个密切相关的细胞因子基因组成的基因组染色体上的跨越。2.大约400 kb的这种基因的多态性被报道与骨质疏松性骨折和胃癌的风险增加有关。已经报道了四个编码不同同种型的可变剪接转录物变体。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

IL1RN基因的碱基序列:[NCBI]
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IL1RN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9005       rs16065       rs128964       rs315919       rs315920       rs315921       rs315922       rs315923       rs315924       rs315925       rs315926       rs315927       rs315928       rs315929       rs315930       rs315931       rs315932      

IL1RN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCCATGGAGGGAAGATGTG
59
CAGTGATGTTAACTGCCTCC
59
ATCCATGGAGGGAAGATGTG
59
CAGTGATGTTAACTGCCTCC
59
TTGAATTGATCTTGGCAGCA
59
CAGTTCCTATTCCTCTTGTGC
59
CAAGCCTTCAGAATCTGGGA
60
TCCTTGCAAGTATCCAGCA
59
GGCTTTAGAGACGATCTGC
58
GGTCTTCTGGTTAACATCCC
58
ATCCATGGAGGGAAGATGTG
59
CAGTGATGTTAACTGCCTCC
59
TGGCAGCAATTCTATGAGAC
58
AAGGAAGAGGTGCAGTTCC
60
CTCAAAGGAGACGATCTGC
58
GGTCTTCTGGTTAACATCCC
58
GGCTTTAGAGACGATCTGC
58
GGTCTTCTGGTTAACATCCC
58
TTCCTGTTCCATTCAGAGAC
57
AACATCCCAGATTCTGAAGG
57
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
NFKB1
IL1RN
Activation
RELA
IL1RN
Activation
STAT3
IL1RN
Activation

IL1RN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IL1RN基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001960
P18510 (UniProtKB)
IEA
GO:0005125
P18510 (UniProtKB)
IBA
GO:0005149
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0005150
P18510 (UniProtKB)
IPI
GO:0005151
P18510 (UniProtKB)
IPI
GO:0005152
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0005152
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0005152
P18510 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P18510 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0005622
P18510 (UniProtKB)
NAS
GO:0005737
P18510 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P18510 (UniProtKB)
TAS
GO:0006629
P18510 (UniProtKB)
IEA
GO:0006953
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0006955
P18510 (UniProtKB)
NAS
GO:0030073
P18510 (UniProtKB)
IEA
GO:0034115
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0045352
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0045353
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0051384
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:2000660
P18510 (UniProtKB)
IDA
GO:2000660
P18510 (UniProtKB)
IDA

可能调控 IL1RN基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
INTERLEUKIN 1 RECEPTOR ANTAGONIST DEFICIENCY 0.360542884 2 2 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
Inflammation 0.248055276 21 0 CTD_human_GAD_LHGDN_RGD
MICROVASCULAR COMPLICATIONS OF DIABETES, SUSCEPTIBILITY TO, 4 (finding) 0.24 0 0 CLINVAR_CTD_human
Stomach Neoplasms 0.219341894 49 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Anorexia 0.2 2 0 CTD_human_RGD
Hyperalgesia 0.2 6 0 CTD_human_RGD
Rheumatoid Arthritis 0.176631795 46 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Asthma 0.154114595 17 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Cerebrovascular accident 0.150909493 18 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Brain Ischemia 0.134473634 8 0 BeFree_CTD_human_GAD

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