ICE2 (interactor of little elongation complex ELL subunit 2)

symbol:
ICE2
locus group:
protein-coding gene
location:
15q22.2
gene_family:
alias symbol:
FLJ11896|BRCC1
alias name:
breast cancer cell 1
entrez id:
79664
ensembl gene id:
ENSG00000128915
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NM_024611
hgnc_id:
HGNC:29885
approved reserved:
2004-12-01
15q22.2
基因染色体位置图

ICE2(Inducer of CBF Expression 2)是植物中一个重要的转录因子,属于CBF/DREB1(C-repeat Binding Factor/Dehydration Responsive Element Binding Protein 1)基因家族。该家族成员在植物应对非生物胁迫(如低温、干旱和高盐)时发挥关键作用,通过调控下游冷响应基因的表达来增强植物的抗逆性。ICE2的主要功能是激活CBF/DREB1基因的表达,进而启动一系列冷响应通路,帮助植物适应低温环境。ICE2蛋白通常含有典型的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域,能够特异性结合目标基因的启动子区域。突变ICE2基因会导致植物对低温的敏感性增加,表现为冷胁迫下存活率下降和生长受抑制。研究表明,ICE2与某些作物(如拟南芥和水稻)的耐寒性密切相关,其表达水平直接影响植物的抗冻能力。当ICE2过表达时,植物通常表现出更强的耐寒性,同时可能激活更多胁迫响应基因(如COR15A和RD29A),但过度表达也可能导致生长迟缓等副作用。相反,降低ICE2表达会使植物更容易受到冷害,并减弱其他胁迫相关基因的诱导。ICE2与同家族的ICE1功能部分冗余,但它们在调控网络中的作用位点和强度可能存在差异。该基因的调控机制涉及蛋白质修饰(如泛素化)和与其他因子(如MYB15)的相互作用,这些机制共同精细调节植物的冷响应过程。

None

ICE2基因的碱基序列:[NCBI]
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ICE2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3068       rs936013       rs1046657       rs1063100       rs1454101       rs1463330       rs1869484       rs1869485       rs1901993       rs2045086       rs2054031       rs2054035       rs2054036       rs2085038       rs2100431       rs2123829       rs2123834      

ICE2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTTCAGACTCCTCTAGTTGG
59
GAAGTTCATATGGCAATCGTCC
60
TGATGTCTCTGAGTAAGTTCTG
57
CACTCTAGCTCACAGTTCAC
58
TTATCCAACAGACGTATAGGAG
57
TTTCCTTTGCTTGAGTTGC
57
GACCATGAGGTCACTTTATCAG
59
TCAGGACTACAAATCAGGCT
59
AGGACTGAATTGGGATATTTCC
58
TTTAAACTTGGAGCCATGGA
58
AGAACAAACAGCTGAAGCT
58
AAGCTTCTCTGCATTTGGA
57
GTCAAAGGACGATATAGCTACC
58
TCATAATGCATAGCTTCAGCTG
59
TTATCCAACAGACGTATAGGAG
57
TTTCCTTTGCTTGAGTTGC
57
CTGATTCACTAGGGCATATCG
58
ACAAGTAGGAACCCTCCTG
58
ACTTTATCAGTCTGCCTGGG
60
GGAAATATCCAGACATCATCAGG
59
      尚未收录相关数据

ICE2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ICE2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q659A1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q659A1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q659A1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q659A1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q659A1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q659A1 (UniProtKB)
TAS
GO:0008023
Q659A1 (UniProtKB)
IMP
GO:0008023
Q659A1 (UniProtKB)
IDA
GO:0015030
Q659A1 (UniProtKB)
IDA
GO:0035327
Q659A1 (UniProtKB)
IDA
GO:0035327
Q659A1 (UniProtKB)
IDA
GO:0035363
Q659A1 (UniProtKB)
IDA
GO:0042795
Q659A1 (UniProtKB)
IMP
GO:0042795
Q659A1 (UniProtKB)
TAS
GO:0042796
Q659A1 (UniProtKB)
IMP
GO:0045945
Q659A1 (UniProtKB)
IMP

可能调控 ICE2基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Cocaine-Related Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Paranoia 0.12 1 0 CTD_human

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