HOXB6 (homeobox B6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HOXB6
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.32
gene_family:
HOXL subclass homeoboxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
3216
ensembl gene id:
ENSG00000108511
ucsc gene id:
uc010dbh.2
refseq accession:
NM_001369397
hgnc_id:
HGNC:5117
approved reserved:
1990-06-15

基因染色体位置

基因染色体位置

17q21.32
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

HOXB6（Homeobox B6）属于HOX基因家族，这是一个高度保守的基因家族，在胚胎发育过程中起关键作用，特别是调控身体前后轴的模式形成和器官发育。HOX基因家族成员共享一个共同的DNA结合域——同源盒（homeobox），编码的蛋白质作为转录因子调控下游靶基因的表达。HOXB6位于人类第17号染色体上的HOXB基因簇中，与其他HOX基因类似，它在胚胎发育中参与肢体、神经系统和造血系统的形成。HOXB6的表达产物是一种转录因子，通过结合特定DNA序列调控细胞分化、增殖和迁移。其主要作用位点包括胚胎的中胚层和造血组织，尤其在造血干细胞的分化和红系细胞发育中发挥重要作用。HOXB6的突变可能导致其功能丧失或异常，进而影响胚胎发育或造血功能，甚至与某些白血病（如急性髓系白血病）的发生相关。研究表明，HOXB6的过表达可能促进细胞增殖并抑制分化，在某些癌症中与肿瘤进展和不良预后相关；而降低表达则可能影响造血干细胞的功能，导致贫血或免疫缺陷。此外，HOXB6与其他HOX家族成员（如HOXA9、HOXB4）协同调控造血和发育过程，其表达失衡可能破坏这种协同作用，进而影响多个信号通路（如Wnt和Notch通路）。HOX基因家族的共性包括高度保守的同源盒序列、在发育中的时空特异性表达以及作为主调控因子协调复杂的基因网络。HOXB6的功能和调控机制仍在深入研究之中，但其在发育和疾病中的重要性已得到广泛认可。

This gene is a member of the Antp homeobox family and encodes a protein with a homeobox DNA-binding domain. It is included in a cluster of homeobox B genes located on chromosome 17. The encoded protein functions as a sequence-specific transcription factor that is involved in development, including that of lung and skin, and has been localized to both the nucleus and cytoplasm. Altered expression of this gene or a change in the subcellular localization of its protein is associated with some cases of acute myeloid leukemia and colorectal cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是ANTP同源家族的成员，并且编码蛋白质有同源DNA结合结构域。它被包括在位于17号染色??体上的编码的蛋白质功能是参与发展，包括肺和皮肤的，并且已被定位于细胞核和细胞质两个序列特异性转录因子同源b基因序列的簇。此基因或其蛋白质的亚细胞定位的变化改变的表达与急性骨髓性白血病和结肠直肠癌的某些情况下，相关联。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对HOXB6基因的介绍     Wikipedia数据库中对HOXB6基因的介绍

基因序列

基因序列

HOXB6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HOXB6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs9221       rs919109       rs1060030       rs1064739       rs1123630       rs1529334       rs2740754       rs3054557       rs3209544       rs3744775       rs4286147       rs4646993       rs4793951       rs6504411       rs6504414       rs7405452       rs9896015      

基因表达

基因表达

HOXB6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAATGCCCAAGTATCTCG
58
AGTAGTATATCCGAGATTGGGT
57
GATGGATGGAAAGGGAGGG
59
CCCAAAGGAGGAACCTGAG
59
AATTCGTGCAACAGTTCCTC
59
AAACTCCTTCTCCAGCTCC
59
ATTCGTGCAACAGTTCCTC
58
GAAACTCCTTCTCCAGCTC
57
ATGGAAAGGGAGGGAAAGAC
59
CCCAAAGGAGGAACCTGAG
59
AGAATGCCCAAGTATCTCG
57
AGTAGTATATCCGAGATTGGGT
57
ATTCGTGCAACAGTTCCTC
58
AAACTCCTTCTCCAGCTCC
59
GAATGCCCAAGTATCTCGC
58
AGTAGTATATCCGAGATTGGGT
57
TGGAAAGGGAGGGAAAGAC
59
CCCAAAGGAGGAACCTGAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

HOXB6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOXB6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003700
P17509 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P17509 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P17509 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
P17509 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
P17509 (UniProtKB)
IEA
GO:0009952
P17509 (UniProtKB)
IEA
GO:0034101
P17509 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P17509 (UniProtKB)
IEA
GO:0044822
P17509 (UniProtKB)
IDA
GO:0048704
P17509 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HOXB6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypospadias 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Embryonal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.000542884 2 0 BeFree
CAMPOMELIC DYSPLASIA 0.000542884 2 0 BeFree
Renal Cell Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Penile hypospadias 0.000271442 1 0 BeFree
Renal carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neurofibromatosis 1 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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