GPATCH2 (G-patch domain containing 2)

symbol:
GPATCH2
locus group:
protein-coding gene
location:
1q41
gene_family:
G patch domain containing|Protein phosphatase 1 regulatory subunits
alias symbol:
FLJ10252|CT110|PPP1R30|Pfa1
alias name:
cancer/testis antigen 110|protein …
entrez id:
55105
ensembl gene id:
ENSG00000092978
ucsc gene id:
uc001hlf.2
refseq accession:
NM_018040
hgnc_id:
HGNC:25499
approved reserved:
2004-05-12
1q41
基因染色体位置图

GPATCH2(G-Patch Domain Containing 2)是一个编码含有G-patch结构域的蛋白质的基因,其功能尚未完全明确,但G-patch结构域通常与RNA结合和RNA代谢相关,可能参与RNA剪接、加工或翻译调控。GPATCH2的表达产物可能在细胞核内发挥作用,影响RNA的稳定性或功能。目前关于GPATCH2的具体作用机制研究较少,但已知其与某些癌症(如乳腺癌和肝癌)的发生发展可能相关,推测其异常表达可能影响细胞增殖或凋亡。若GPATCH2发生突变,可能干扰其RNA结合能力,从而影响相关RNA代谢过程,但目前尚无明确的致病性突变报道。GPATCH2过表达可能促进细胞异常增殖,而降低表达则可能影响RNA的正常加工,但具体机制仍需进一步研究。GPATCH2属于G-patch基因家族,该家族成员均含有保守的G-patch结构域,通常与RNA结合蛋白相互作用,参与转录后调控。该家族基因在进化上较为保守,可能在RNA代谢中发挥基础性作用。目前关于GPATCH2的研究仍处于初步阶段,其详细功能及调控网络有待深入探索。

None

GPATCH2基因的碱基序列:[NCBI]
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GPATCH2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs166449       rs169085       rs171946       rs187845       rs265114       rs265123       rs265124       rs265125       rs265126       rs265127       rs265128       rs265129       rs265130       rs265131       rs265132       rs265133       rs265134      

GPATCH2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACTGCAGGATTTGTAGGTG
57
CAGCCCATATTCTGAAGCA
58
TTTCCAAGCTAGACTCAGTCG
60
GTTTGTAGCCATTGAAGTTGGA
60
TCCAACTTCAATGGTACCCA
59
TCATGGTGATGAGAATCCGG
59
TGAAAGTTGGAAGCATCAGC
59
TTACCTGCTGGCTGTTCTC
60
TCCAACTTCAATGGTACCCA
59
TCATGGTGATGAGAATCCGG
60
ACGAACCAGACCAATAAGGA
58
TGCTGGAATCACTTTCACTC
58
TAGGTTCCCTCTAACTGCCT
59
ATTAGTGACCTGGTCATGCT
58
TCTGAAAGTTGGAAGGTGG
57
GCTTTACCATTTACAACCTGTG
58
ACTACTGCAGGATTTGTAGGT
59
GCCCATATTCTGAAGCATTCG
60
GAAAGTTGGAAGCATCAGCT
59
TTACCTGCTGGCTGTTCTC
60
      尚未收录相关数据

GPATCH2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPATCH2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
Q9NW75 (UniProtKB)
IEA
GO:0005730
Q9NW75 (UniProtKB)
IEA
GO:0010923
Q9NW75 (UniProtKB)
IDA
GO:0016607
Q9NW75 (UniProtKB)
IEA

可能调控 GPATCH2基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree

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