GACAT3 (gastric cancer associated transcript 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GACAT3
locus group:
non-coding RNA
location:
2p24.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
lncRNA-AC130710
alias name:
None
entrez id:
104797537
ensembl gene id:
ENSG00000236289
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_126559
hgnc_id:
HGNC:50847
approved reserved:
2014-06-25

基因染色体位置

基因染色体位置

2p24.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

GACAT3（Gastric Cancer Associated Transcript 3）是一种长链非编码RNA（lncRNA），主要与胃癌的发生发展相关。它在多种癌症中异常表达，尤其在胃癌组织中显著高表达，可能通过调控细胞增殖、迁移和侵袭等过程促进肿瘤进展。GACAT3的生物学功能涉及作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，例如可能通过miR-149/MMP2轴影响肿瘤转移。该基因的主要作用位点可能在细胞质，参与转录后调控网络。若GACAT3发生突变或表达异常，可能导致其ceRNA功能失调，进而影响下游信号通路（如Wnt/β-catenin或PI3K/AKT），加剧肿瘤恶性表型。GACAT3过表达通常与胃癌临床分期晚、预后差相关，而降低其表达可抑制癌细胞生长和转移能力。该基因属于GACAT家族（包括GACAT1、GACAT2等），该家族成员均为胃癌相关lncRNA，具有组织特异性高表达、调控肿瘤微环境及表观遗传修饰等共性特征。目前研究还发现GACAT3可能与其他消化道肿瘤（如结直肠癌）相关，但其具体机制仍需进一步探索。

None

无

OMIM数据库中对GACAT3基因的介绍     Wikipedia数据库中对GACAT3基因的介绍

基因序列

基因序列

GACAT3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GACAT3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs934058       rs934059       rs1365970       rs1365971       rs1365972       rs1427682       rs1984431       rs2007559       rs2114797       rs4073262       rs4073263       rs4499395       rs4669034       rs4669035       rs6431753       rs6431754       rs6431755      

基因表达

基因表达

GACAT3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGGAGGATAATAGCCAGC
57
ATGAGTTGATGGTTTCTAGGG
58
CAGGTGGAAGGTCTTAAGAG
57
AGCTGAAATTGAATCCACCT
58
TCAGGTGGAAGGTCTTAAGAG
59
CTGAAATTGAATCCACCTTTGG
58
GAGGATAATAGCCAGCTCCTG
60
GTCATGAGTTGATGGTTTCTAGG
59
GCAGGAGGATAATAGCCAG
57
TGAGTTGATGGTTTCTAGGG
57
CAGGTGGAAGGTCTTAAGAG
57
CTGAAATTGAATCCACCTTTGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GACAT3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GACAT3基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GACAT3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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