GACAT2 (gastric cancer associated transcript 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GACAT2
locus group:
non-coding RNA
location:
18p11.22
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
HMlincRNA717
alias name:
None
entrez id:
100287082
ensembl gene id:
ENSG00000265962
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_120598
hgnc_id:
HGNC:50516
approved reserved:
2014-05-14

基因染色体位置

基因染色体位置

18p11.22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

GACAT2（Gastric Cancer Associated Transcript 2）是一种长链非编码RNA（lncRNA），最初在胃癌中被发现，属于非编码RNA家族。该基因位于人类染色体11q13.1区域，其表达产物不编码蛋白质，但通过调控其他基因的表达参与多种生物学过程。GACAT2在胃癌、结直肠癌、肝癌等多种癌症中异常高表达，与肿瘤的发生、发展及转移密切相关。其生物学功能主要包括调控细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭，可能通过作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除miRNA对靶基因的抑制作用，影响下游信号通路（如Wnt/β-catenin、PI3K/AKT等）。GACAT2的突变或表达异常可能导致其调控功能紊乱，进而促进肿瘤进展。例如，在胃癌中，GACAT2的高表达与患者预后不良相关，可能通过激活EMT（上皮-间质转化）过程增强肿瘤细胞的侵袭性。降低GACAT2表达可抑制肿瘤细胞增殖和转移，而过表达则可能促进这些恶性表型。GACAT2属于lncRNA家族，该家族成员通常不编码蛋白质，但通过调控染色质修饰、转录及转录后过程影响基因表达。GACAT2与某些家族成员（如HOTAIR、MALAT1）类似，在癌症中发挥重要作用。此外，GACAT2还可能参与免疫调节和炎症反应，但其具体机制仍需进一步研究。目前，GACAT2被视为潜在的癌症诊断标志物和治疗靶点。

None

无

OMIM数据库中对GACAT2基因的介绍     Wikipedia数据库中对GACAT2基因的介绍

基因序列

基因序列

GACAT2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GACAT2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs471078       rs476851       rs487249       rs501428       rs552150       rs554015       rs556293       rs605533       rs606375       rs606450       rs657568       rs1549074       rs1549076       rs1861951       rs1893056       rs2052399       rs2726345      

基因表达

基因表达

GACAT2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTTCCTACAGTGACAACTG
58
ATCTCTACTTCTGTTTCGACAG
58
CTGTTCCTACAGTGACAACTG
59
TCTCTACTTCTGTTTCGACAGG
60
CACCTGTTCCTACAGTGAC
58
CTACTTCTGTTTCGACAGGT
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GACAT2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GACAT2基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GACAT2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Early gastric cancer 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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