GACAT1 (gastric cancer associated transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GACAT1
locus group:
non-coding RNA
location:
2q12.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
LINC00876|AC096655.1-002
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
104326057
ensembl gene id:
ENSG00000232991
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_126369
hgnc_id:
HGNC:48336
approved reserved:
2013-05-05

基因染色体位置

基因染色体位置

2q12.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

GACAT1（Gastric Cancer Associated Transcript 1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），最初在胃癌中被发现，其表达水平与胃癌的发生发展密切相关。GACAT1在多种癌症中异常表达，尤其在胃癌、结直肠癌和肝癌中显著上调，可能通过调控细胞增殖、迁移和侵袭促进肿瘤进展。研究表明，GACAT1通过作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（如miR-149-5p、miR-1271等），解除这些miRNA对下游靶基因（如FOXM1、TGF-β等）的抑制作用，从而激活致癌信号通路（如Wnt/β-catenin、PI3K/AKT）。GACAT1的过表达与肿瘤恶性程度、转移和不良预后相关，而敲低GACAT1可抑制肿瘤细胞生长并诱导凋亡。此外，GACAT1可能参与免疫逃逸，例如通过调节PD-L1表达影响肿瘤微环境。目前尚未明确GACAT1是否属于特定基因家族，但作为lncRNA，其共性包括调控基因表达、剪接或表观遗传修饰，且多数通过RNA-RNA或RNA-蛋白相互作用发挥作用。GACAT1的突变研究较少，但其表达水平变化已成为癌症诊断和治疗的潜在生物标志物或靶点。

None

无

OMIM数据库中对GACAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对GACAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

GACAT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GACAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs167869       rs179178       rs328023       rs328024       rs328026       rs328027       rs328028       rs328029       rs328030       rs328031       rs328032       rs328033       rs328034       rs328035       rs328036       rs700855       rs700856      

基因表达

基因表达

GACAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCAGCTGTTCTGTTGCC
60
TTCTGGACTCTAGAAAGGGTC
59
CCATCAGCTGTTCTGTTGC
60
CTGGACTCTAGAAAGGGTCTC
59
CATCAGCTGTTCTGTTGCC
60
CTGGACTCTAGAAAGGGTCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GACAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GACAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GACAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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