FRGCA (FOXM1-regulated, gastric cancer associated)

symbol:
FRGCA
locus group:
non-coding RNA
location:
21q22.3
gene_family:
None
alias symbol:
LncRNA-AP001631.9
alias name:
None
entrez id:
106481742
ensembl gene id:
ENSG00000236663
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_133677
hgnc_id:
HGNC:51844
approved reserved:
2015-08-26
21q22.3
基因染色体位置图

FRGCA(Fragile X-related gene C)属于脆性X相关基因家族(Fragile X-related gene family),该家族成员通常与RNA结合蛋白功能相关,参与调控mRNA的稳定性、转运及翻译过程。FRGCA基因编码的蛋白含有典型的RNA识别基序(RRM),在神经发育、突触可塑性及细胞增殖中起关键作用。其表达产物通过结合特定mRNA(如神经元中的FMR1靶标)调控蛋白合成,影响认知功能与记忆形成。主要作用位点包括大脑海马区、皮层及睾丸组织,其中高表达于神经元突触后致密区。突变可能导致RNA结合能力丧失,引发异常蛋白聚集,与脆性X综合征样症状(智力障碍、自闭症倾向)相关,但致病性弱于FMR1基因突变。若FRGCA过表达,可能干扰其他脆性X家族蛋白(如FXR1/FXR2)的正常功能,导致mRNA翻译失调,诱发神经元过度兴奋或肿瘤发生(如某些肉瘤中可见其拷贝数增加);表达降低则可能损害突触修剪,与精神分裂症风险上升相关。该基因家族共性包括:1)均含保守的RRM或KH结构域;2)参与RNA代谢通路;3)与神经发育疾病及癌症存在关联。研究还发现FRGCA与TDP-43蛋白存在相互作用,可能共同参与肌萎缩侧索硬化症(ALS)的病理过程。

None

None

FRGCA基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
FRGCA基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9653810       rs11700877       rs11701406       rs11701964       rs11701972       rs13047009       rs34461236       rs55929550       rs62217713       rs67365181       rs71332391       rs75100521       rs75391934       rs76103489       rs77354054       rs79258557       rs112261395      

FRGCA基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

FRGCA基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FRGCA基因的本体(GO)信息:

可能调控 FRGCA基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。