FALEC (focally amplified long non-coding RNA in epithelial cancer)

symbol:
FALEC
locus group:
non-coding RNA
location:
1q21.2
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
ncRNA-a1|FAL1
alias name:
focally amplified lncRNA on chromo…
entrez id:
100874054
ensembl gene id:
ENSG00000228126
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_051960
hgnc_id:
HGNC:43713
approved reserved:
2012-02-02
1q21.2
基因染色体位置图

FALEC(Focally Amplified Long Non-Coding RNA on Chromosome 1)是一种位于人类1号染色体上的长链非编码RNA(lncRNA),属于lncRNA基因家族。该家族成员通常不编码蛋白质,但通过调控基因表达参与多种生物学过程。FALEC最初被发现是在食管鳞状细胞癌(ESCC)中局部扩增的lncRNA,其表达异常与肿瘤发生发展密切相关。FALEC的生物学功能主要体现在促进细胞增殖、迁移和侵袭,其作用机制可能与调控下游靶基因或信号通路有关。研究表明,FALEC在多种癌症中过表达,如食管癌、肝癌和肺癌,其高表达与肿瘤恶性程度和不良预后相关。FALEC可能通过竞争性结合microRNA(如miR-342-3p)或与蛋白质相互作用(如转录因子)来发挥致癌作用。当FALEC表达降低时,肿瘤细胞的增殖和转移能力会受到抑制,提示其作为潜在治疗靶点的价值。目前尚未报道FALEC基因本身的突变对其功能的影响,但其表达水平的改变显著影响肿瘤进程。FALEC属于lncRNA基因家族,该家族成员的共性是长度超过200个核苷酸、缺乏蛋白编码能力,但可通过表观遗传调控、转录调控或信号通路调控等方式影响细胞功能。FALEC的异常表达不仅影响肿瘤相关基因,还可能干扰细胞周期、凋亡和上皮-间质转化(EMT)等过程。未来研究需要进一步揭示FALEC的具体分子机制及其在不同癌症中的调控网络。

None

FALEC基因的碱基序列:[NCBI]
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FALEC基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6704384       rs74520877       rs75470877       rs112603952       rs138636989       rs143551091       rs148022743       rs148914344       rs183810605       rs369784263       rs373855797       rs587643479       rs587687079       rs587710463       rs7513247       rs9436125       rs9436126      

FALEC基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCCAAGAAGCTCATACTGAC
59
ATTGAACTCATGTCTTCCCTC
58
GGCCAAGAAGCTCATACTG
58
GAACTCATGTCTTCCCTCTG
58
GCCAAGAAGCTCATACTGAC
59
TGAACTCATGTCTTCCCTCTG
60
      尚未收录相关数据

FALEC基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FALEC基因的本体(GO)信息:

可能调控 FALEC基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Cancer Cell Growth 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree

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