ERGIC3 (ERGIC and golgi 3)

symbol:
ERGIC3
locus group:
protein-coding gene
location:
20q11.22
gene_family:
alias symbol:
CGI-54|PRO0989|NY-BR-84|Erv46
alias name:
None
entrez id:
51614
ensembl gene id:
ENSG00000125991
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uc002xcs.4
refseq accession:
NM_015966
hgnc_id:
HGNC:15927
approved reserved:
2001-07-31
20q11.22
基因染色体位置图

ERGIC3(内质网-高尔基体中间区室3,英文全称Endoplasmic Reticulum-Golgi Intermediate Compartment 3)属于ERGIC基因家族,该家族成员主要参与细胞内蛋白质的运输和分泌途径,特别是介导内质网(ER)与高尔基体之间的囊泡运输。ERGIC3编码的蛋白质定位于ERGIC区室(内质网与高尔基体之间的动态膜结构),与其他ERGIC家族成员(如ERGIC1和ERGIC2)共同维持分泌途径的稳态。ERGIC家族蛋白的共性包括参与囊泡形成、货物分选和膜运输调控,对维持细胞内膜系统功能至关重要。ERGIC3的生物学功能涉及协助新合成蛋白质从内质网向高尔基体的转运,其表达产物可能作为运输复合物的组分或调控因子发挥作用。若ERGIC3发生功能丧失性突变,可能导致蛋白质运输障碍,引发内质网应激(ER stress,即内质网因未折叠蛋白积累而触发的应激反应)或分泌途径紊乱,进而影响细胞稳态。目前研究表明,ERGIC3的异常表达可能与某些神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)或癌症相关,但其具体机制尚不明确。当ERGIC3过表达时,可能干扰ERGIC区室的正常功能,导致其他运输相关基因(如COPII囊泡组分基因)的表达失衡;而表达降低则可能损害蛋白质分泌效率,影响依赖该途径的细胞功能(如激素释放或细胞外基质形成)。需要注意的是,ERGIC3的研究相对较少,其详细分子机制和病理关联仍需进一步探索。专业术语解释:内质网是细胞内负责蛋白质合成与折叠的细胞器;高尔基体是修饰、分选蛋白质的细胞器;囊泡运输指通过膜泡在细胞器间转运物质的过程。

None

ERGIC3基因的碱基序列:[NCBI]
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ERGIC3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs8825       rs224411       rs224412       rs224413       rs224414       rs224415       rs224416       rs224417       rs224418       rs224419       rs224420       rs224421       rs224422       rs1058805       rs2104417       rs3790136       rs6058258      

ERGIC3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGCCTCCATGATGTTCC
58
TTTCCTGTTGAGCCTCTCC
59
CATGCCTTGTGCCTATCTG
58
GTTGCTTGAACAGGTTGTG
57
AGAAGCACAGGTCCTTCAC
59
GAGCGAATCGATGAGTCCA
59
AGATATCAAGTGCTGTAACACC
58
GTATCTGGGTTCTTGAAGGC
58
CTAATGACGCCTTCTCCCT
58
ATCATGGAGGGTTGTCAAGG
59
CATGCCTTGTGCCTATCTG
58
CTTGAACAGGTTGTGTTCCA
58
GAAGATATCAAGTGCTGTAACACC
59
ATCTGGGTTCTTGAAGGCC
59
AGAAGCACAGGTCCTTCAC
59
AGCGAATCGATGAGTCCAG
59
AAGCCTCCATGATGTTCCA
59
TTTCCTGTTGAGCCTCTCC
59
ACTAATGACGCCTTCTCCC
59
TCATGGAGGGTTGTCAAGG
59
      尚未收录相关数据

ERGIC3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ERGIC3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A0C4DH46 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A6PVJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y5K5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y621 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y6Z0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y802 (UniProtKB)
IEA
GO:0005789
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0005794
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q9Y282 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0016192
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0033116
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ERGIC3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree

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