EFCAB13-DT (EFCAB13 divergent transcript)

symbol:
EFCAB13-DT
locus group:
non-coding RNA
location:
17q21.32
gene_family:
None
alias symbol:
THCAT158
alias name:
thyroid cancer-associated transcri…
entrez id:
102724508
ensembl gene id:
ENSG00000263293
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refseq accession:
NR_110880
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HGNC:55338
approved reserved:
2020-10-21
17q21.32
基因染色体位置图

EFCAB13-DT是一个长链非编码RNA(lncRNA)基因,位于人类染色体13号上。它属于EFCAB13基因的假基因转录本,通常不编码蛋白质,但可能通过调控其他基因的表达来发挥生物学功能。长链非编码RNA在多种细胞过程中扮演重要角色,包括染色质重塑、转录调控和翻译后修饰等。EFCAB13-DT的具体功能尚未完全明确,但研究表明它可能参与细胞增殖、分化和信号转导等过程。由于lncRNA通常具有组织特异性表达模式,EFCAB13-DT可能在特定组织或发育阶段发挥调控作用。目前关于该基因突变的研究较少,但lncRNA的异常表达或突变通常会影响其靶基因的调控,可能导致疾病发生。一些研究表明,EFCAB13-DT可能与某些癌症的发生发展相关,但其确切机制仍需进一步探索。如果EFCAB13-DT过表达,可能会干扰其靶基因的正常调控网络,导致细胞周期异常或信号通路紊乱;而降低表达则可能影响依赖它的调控过程。该基因属于长链非编码RNA家族,这类RNA分子通常长度超过200个核苷酸,不编码蛋白质,但能通过多种机制调控基因表达。长链非编码RNA家族的共性包括:在进化上相对保守性较低,表达具有组织特异性,以及通过RNA-RNA、RNA-DNA或RNA-蛋白质相互作用来调控基因表达。随着研究的深入,EFCAB13-DT的具体功能和临床意义将更加清晰。

None

None

EFCAB13-DT基因的碱基序列:[NCBI]
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EFCAB13-DT基因的碱基突变:           仅显示部分snp

EFCAB13-DT基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

EFCAB13-DT基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

EFCAB13-DT基因的本体(GO)信息:

可能调控 EFCAB13-DT基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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