DSC3 (desmocollin 3)

symbol:
DSC3
locus group:
protein-coding gene
location:
18q12.1
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
CDHF3|DSC|DSC1|DSC2
alias name:
None
entrez id:
1825
ensembl gene id:
ENSG00000134762
ucsc gene id:
uc002kwj.5
refseq accession:
NM_001941|NM_024423
hgnc_id:
HGNC:3037
approved reserved:
1991-03-04
18q12.1
基因染色体位置图

DSC3(Desmocollin-3)是钙黏蛋白超家族中桥粒胶蛋白(Desmocollin)基因家族的成员之一,该家族包括DSC1、DSC2和DSC3三个亚型,主要参与细胞间黏附结构的形成,特别是在桥粒(一种细胞间连接结构)中发挥关键作用。DSC3基因编码的蛋白是一种跨膜糖蛋白,主要在上皮组织中表达,尤其在皮肤、口腔黏膜和食道等复层上皮中高度富集。它的生物学功能是通过与桥粒芯蛋白(Desmoglein)等其他桥粒成分相互作用,维持组织的机械强度和细胞间信号传递。DSC3的突变或表达异常可能导致桥粒结构缺陷,进而影响上皮组织的完整性和屏障功能。研究发现,DSC3的功能丧失性突变与某些皮肤疾病如掌跖角化症和遗传性大疱性表皮松解症有关,表现为皮肤脆弱和易起水疱。此外,DSC3的表达异常也与多种癌症相关,例如在头颈部鳞状细胞癌和食管癌中,DSC3的表达常显著降低,这可能通过破坏细胞间黏附促进肿瘤侵袭和转移。相反,在某些情况下,DSC3的过表达可能通过增强细胞间连接抑制肿瘤细胞的迁移能力。DSC3基因家族的共性在于它们都含有钙离子结合域,依赖钙离子维持蛋白稳定性,并在上皮组织中特异性表达以维持组织结构和功能。DSC3的表达水平受多种转录因子和表观遗传调控影响,例如DNA甲基化可能抑制其表达。降低DSC3表达会削弱细胞间黏附,导致上皮屏障功能受损,而过度表达可能增强组织稳定性但可能干扰正常细胞更新。此外,DSC3还参与细胞信号通路如Wnt和NF-κB的调控,影响细胞增殖和分化。因此,DSC3不仅是维持上皮组织稳态的关键分子,其表达失衡还可能直接参与多种疾病的发病机制。

The protein encoded by this gene is a calcium-dependent glycoprotein that is a member of the desmocollin subfamily of the cadherin superfamily. These desmosomal family members, along with the desmogleins, are found primarily in epithelial cells where they constitute the adhesive proteins of the desmosome cell-cell junction and are required for cell adhesion and desmosome formation. The desmosomal family members are arranged in two clusters on chromosome 18, occupying less than 650 kb combined. Mutations in this gene are a cause of hypotrichosis and recurrent skin vesicles disorder. The protein can act as an autoantigen in pemphigus diseases, and it is also considered to be a biomarker for some cancers. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2014]

由该基因编码的蛋白质是钙依赖性的糖蛋白,它是钙粘蛋白家族的desmocollin亚科的成员。这些桥粒的家庭成员,与desmogleins一起,主要在它们构成了桥粒细胞 - 细胞连接的粘合蛋白质和所需的细胞粘附和桥粒的形成上皮细胞中发现。桥粒家庭成员被安排在18号染色体上两个集群,占地不到650 KB的总和。这种基因突变是少毛??症的原因和复发性水疱症。该蛋白质可以充当在天疱疮疾病的自身抗原,它也被认为是某些癌症的生物标志物。这个基因的选择性剪接的结果在多个转录变体。 [由RefSeq的,2014年4月提供]

DSC3基因的碱基序列:[NCBI]
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DSC3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs8765       rs166724       rs166725       rs169347       rs175776       rs175777       rs185714       rs190681       rs202439       rs276910       rs276911       rs276912       rs276913       rs276914       rs276915       rs276916       rs276917      

DSC3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATAGAGTGTGCTCTGCCA
59
CATTCCTGATCCCATAGTACCA
59
CATCAGAAGAAGGTATCGAAGAC
59
AGGAATAGGTGCCCATCTC
59
CATCAGAAGAAGGTATCGAAGAC
59
AGGAATAGGTGCCCATCTC
59
CATCATACCCTGGACTCCT
58
AATGGATTCTTCACCGAGAC
58
ATCATACCCTGGACTCCTG
58
AATGGATTCTTCACCGAGAC
58
TGACCCTCGTGATCTTCAG
59
TGTCTGCCTCTAGTTTAGAAGG
59
TGACCCTCGTGATCTTCAG
59
TGTCTGCCTCTAGTTTAGAAGG
59
GATAGAGTGTGCTCTGCCA
59
ATTCCTGATCCCATAGTACCAC
59
GTGGACAACTGCAGATACAC
59
GTGTCCTCTAATGGATTCTTCAC
59
GATAGAGTGTGCTCTGCCA
59
TTCCTGATCCCATAGTACCAC
59
      尚未收录相关数据

DSC3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DSC3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
J3QRL9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3QRL9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q14574 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q14574 (UniProtKB)
IEA
GO:0005911
Q14574 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q14574 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q14574 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q14574 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q14574 (UniProtKB)
IEA
GO:0030057
Q14574 (UniProtKB)
IEA
GO:0045295
Q14574 (UniProtKB)
IPI
GO:0050821
Q14574 (UniProtKB)
IDA

可能调控 DSC3基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypotrichosis And Recurrent Skin Vesicles 0.360271442 1 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
Mammary Neoplasms 0.125720142 3 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Neoplasm Metastasis 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
ovarian neoplasm 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Arrhythmogenic Right Ventricular Dysplasia 0.001085767 4 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree

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