DSC2 (desmocollin 2)

symbol:
DSC2
locus group:
protein-coding gene
location:
18q12.1
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
CDHF2
alias name:
None
entrez id:
1824
ensembl gene id:
ENSG00000134755
ucsc gene id:
uc002kwl.5
refseq accession:
NM_004949
hgnc_id:
HGNC:3036
approved reserved:
1997-05-29
18q12.1
基因染色体位置图

DSC2(Desmocollin-2)是钙黏蛋白超家族中桥粒胶蛋白(Desmocollin)基因家族的成员之一,该家族包括DSC1、DSC2和DSC3三个亚型,主要参与细胞间黏附结构的形成。DSC2基因编码的蛋白是桥粒的重要组成部分,桥粒是细胞间连接结构,尤其在承受机械压力的组织中(如皮肤、心肌)发挥关键作用,确保细胞间牢固黏附并维持组织完整性。DSC2蛋白通过钙依赖性方式与桥粒芯蛋白(Desmoglein)相互作用,形成跨膜连接网络,传递机械张力并参与细胞信号传导。DSC2基因突变可导致桥粒功能异常,与多种疾病相关,例如致心律失常性右室心肌病(ARVC),这是一种以心肌被纤维脂肪组织替代为特征的心脏疾病,患者易发心律失常甚至猝死。DSC2突变会破坏心肌细胞间连接,导致细胞分离和病理性重塑。此外,DSC2表达异常还与某些上皮性肿瘤(如胃癌、结肠癌)的进展相关,其表达下调可能促进肿瘤细胞侵袭转移。DSC2过表达在体外实验中显示能增强细胞聚集能力,但具体生理影响仍需进一步研究。该基因家族成员的共性是均含有胞外钙结合域、跨膜区和高度保守的胞内结构域,但各亚型具有组织特异性分布,例如DSC2在心肌和上皮基底细胞中占主导。研究DSC2有助于理解细胞黏附机制及相关疾病的病理基础,并为ARVC等疾病的基因诊断提供靶点。

This gene encodes a member of the desmocollin protein subfamily. Desmocollins, along with desmogleins, are cadherin-like transmembrane glycoproteins that are major components of the desmosome. Desmosomes are cell-cell junctions that help resist shearing forces and are found in high concentrations in cells subject to mechanical stress. This gene is found in a cluster with other desmocollin family members on chromosome 18. Mutations in this gene are associated with arrhythmogenic right ventricular dysplasia-11, and reduced protein expression has been described in several types of cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2015]

该基因编码的desmocollin蛋白亚家族的一个成员。 Desmocollins与desmogleins一起,是钙粘跨膜糖蛋白是桥粒的主要组件。桥粒是细胞间的连接处,可以帮助抵抗剪切力和高浓度被发现在受到机械应力细胞。该基因与其他desmocollin家族成员在染色体18在这个基因的突变与致心律失常性右心室发育不良-11相关联的簇被发现,并进一步降低了蛋白质表达已在几种类型的癌症进行了描述。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2015年2月提供]

DSC2基因的碱基序列:[NCBI]
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DSC2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs868333       rs981406       rs981407       rs1260745       rs1271707       rs1550236       rs1550237       rs1612474       rs1613246       rs1614381       rs1617629       rs1658124       rs1658125       rs1658127       rs1658128       rs1658129       rs1789047      

DSC2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGATGATTTAGCCCAGCA
57
AGCCATTCGCAGAATACAC
58
TGAAAGGAGGACACCAGAC
59
TAATGGATTCTTCACCAAGACG
59
CTGATGATTTAGCCCAGCA
58
AGCCATTCGCAGAATACAC
58
TTGCATCAGACCAAGGAGG
59
TGAATGGGCTGTTATCATTCAC
59
TGAAAGGAGGACACCAGAC
59
AATGGATTCTTCACCAAGACG
59
TTGCATCAGACCAAGGAGG
60
TGAATGGGCTGTTATCATTCAC
59
CTGATGATTTAGCCCAGCAG
58
AGCCATTCGCAGAATACAC
58
CTGATGATTTAGCCCAGCAG
59
AGCCATTCGCAGAATACAC
58
GTGGACAACTGCAGATACAC
59
GTGTCCTCTAATGGATTCTTCAC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CDX1
DSC2
Unknown
CDX2
DSC2
Unknown

DSC2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DSC2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q02487 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q02487 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q02487 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q02487 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q02487 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q02487 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q02487 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0005913
Q02487 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q02487 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q02487 (UniProtKB)
IEA
GO:0009267
Q02487 (UniProtKB)
IEA
GO:0014704
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0014704
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0014704
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q02487 (UniProtKB)
IEA
GO:0030057
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0030057
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0031410
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q02487 (UniProtKB)
IDA
GO:0086042
Q02487 (UniProtKB)
IMP
GO:0086073
Q02487 (UniProtKB)
IMP
GO:0086083
Q02487 (UniProtKB)
IC
GO:0086091
Q02487 (UniProtKB)
IMP
GO:0098911
Q02487 (UniProtKB)
IMP

可能调控 DSC2基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Arrhythmogenic Right Ventricular Dysplasia, Familial, 11 0.36 2 8 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Arrhythmogenic Right Ventricular Dysplasia 0.138088254 16 2 BeFree_CLINVAR_GAD_LHGDN
Cardiomyopathies 0.123181358 4 13 BeFree_CLINVAR_GAD
Cardiomyopathy, Dilated 0.122367032 1 1 CLINVAR_GAD
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Colonic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Sudden Cardiac Death 0.002367032 1 0 GAD
Cardiac Arrhythmia 0.002367032 1 0 GAD
Neoplasm Metastasis 0.001085767 4 0 BeFree

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