DPPA2 (developmental pluripotency associated 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DPPA2
locus group:
protein-coding gene
location:
3q13.13
gene_family:
alias symbol:
PESCRG1|CT100
alias name:
cancer/testis antigen 100
entrez id:
151871
ensembl gene id:
ENSG00000163530
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uc003dxo.3
refseq accession:
NM_138815
hgnc_id:
HGNC:19197
approved reserved:
2005-01-19

基因染色体位置

基因染色体位置

3q13.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

DPPA2（Developmental Pluripotency Associated 2）是一种在早期胚胎发育和干细胞多能性维持中起关键作用的基因，属于DPPA基因家族。该家族还包括DPPA3、DPPA4和DPPA5等成员，它们共同的特点是主要在胚胎干细胞（ESCs）和原始生殖细胞（PGCs）中高表达，参与调控细胞的多能性和表观遗传修饰。DPPA2编码的蛋白质含有SAP结构域（SAF-A/B、Acinus和PIAS结构域），这种结构域通常与DNA结合和染色质重塑相关，表明DPPA2可能在基因表达调控中发挥作用。研究表明，DPPA2在维持胚胎干细胞的自我更新和多能性中具有重要作用，它通过与其他多能性因子（如OCT4、SOX2和NANOG）相互作用，调控下游靶基因的表达。DPPA2的突变或表达异常可能导致胚胎发育缺陷，甚至引发早期流产或发育障碍。此外，DPPA2在多种癌症中异常表达，例如在睾丸生殖细胞肿瘤和某些白血病中过表达，可能与肿瘤的发生和发展相关。DPPA2过表达可能促进细胞增殖并抑制分化，而降低其表达则可能导致多能性丧失和细胞分化异常。DPPA2还参与表观遗传调控，影响DNA甲基化和组蛋白修饰，从而影响基因的沉默或激活。在DPPA基因家族中，各成员功能相似但又有独特的作用，例如DPPA3主要参与原始生殖细胞的发育和表观遗传重编程，而DPPA4和DPPA5也在多能性维持中发挥作用。总之，DPPA2是一个重要的发育相关基因，对胚胎干细胞的多能性和早期胚胎发育至关重要，其异常表达或突变可能导致发育异常或疾病，尤其在癌症中可能发挥促癌作用。

None

无

OMIM数据库中对DPPA2基因的介绍     Wikipedia数据库中对DPPA2基因的介绍

基因序列

基因序列

DPPA2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DPPA2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1163444       rs1163445       rs1163446       rs2625620       rs2625621       rs2625622       rs2699955       rs2699956       rs2699957       rs2699958       rs2699984       rs2699985       rs2699986       rs2930079       rs2951409       rs2951410       rs4855717      

基因表达

基因表达

DPPA2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCAAGAAGAATTTCTTGGAGG
59
TGCGTCATCTTTAACTGGC
59
GCAGCAAGAAGAATTTCTTGGA
60
CGTCATCTTTAACTGGCACC
59
GCAGCAAGAAGAATTTCTTGG
59
CGTCATCTTTAACTGGCACC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DPPA2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DPPA2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003682
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IEA
GO:0019827
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IEA
GO:0031060
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IEA
GO:0060484
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IEA
GO:2000648
Q7Z7J5 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DPPA2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lung Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Embryonal Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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