DEPDC1B (DEP domain containing 1B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DEPDC1B
locus group:
protein-coding gene
location:
5q12.1
gene_family:
alias symbol:
XTP1|BRCC3
alias name:
breast cancer cell 3
entrez id:
55789
ensembl gene id:
ENSG00000035499
ucsc gene id:
uc003jsh.4
refseq accession:
NM_018369
hgnc_id:
HGNC:24902
approved reserved:
2004-06-04

基因染色体位置

基因染色体位置

5q12.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

DEPDC1B（DEP Domain Containing 1B）是一个参与细胞周期调控和细胞迁移的基因，属于DEPDC1基因家族。该家族成员通常含有DEP结构域（Dishevelled、EGL-10和Pleckstrin同源结构域），这一结构域在蛋白质-蛋白质相互作用中起关键作用，尤其在信号转导和细胞极性调控中具有重要功能。DEPDC1B编码的蛋白通过与细胞骨架相关蛋白相互作用，影响细胞形态和运动能力，并在有丝分裂中调控纺锤体组装和染色体分离。研究表明，DEPDC1B在多种癌症中过表达，如乳腺癌、肝癌和结直肠癌，其高表达可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡来驱动肿瘤发展。此外，DEPDC1B的突变或表达异常可能导致细胞周期紊乱，增加基因组不稳定性，从而诱发癌症或其他增殖性疾病。降低DEPDC1B表达可通过抑制细胞周期进程和诱导凋亡来抑制肿瘤生长，表明它可能是一个潜在的治疗靶点。DEPDC1B还与神经系统发育相关，其异常表达可能影响神经元迁移和突触形成。该基因的调控机制涉及多种转录因子和表观遗传修饰，如DNA甲基化和组蛋白修饰。DEPDC1B的功能研究为理解癌症发生和神经系统疾病提供了新的视角，但其具体分子机制仍需进一步探索。

None

无

OMIM数据库中对DEPDC1B基因的介绍     Wikipedia数据库中对DEPDC1B基因的介绍

基因序列

基因序列

DEPDC1B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DEPDC1B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs206789       rs286148       rs286149       rs286150       rs286151       rs286152       rs286153       rs286154       rs286155       rs286156       rs286157       rs286158       rs286159       rs726268       rs897671       rs897672       rs1026418      

基因表达

基因表达

DEPDC1B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAATTCCAGCACTTTGGGAG
57
TCTCATTCCACATGTTGGTC
57
GAATGATCAGGACTACTTTGCA
58
GTAACAAACCTTCGTCACCT
58
CCAGAATGGAATGATCTCCC
57
ACCACATCTCAGAATTCATCAC
58
GTAATTCCAGCACTTTGGGAG
59
CTCATTCCACATGTTGGTCAG
59
GGTGACGAAGGTTTGTTACAG
59
CCTCATCAATAGCTGTAACTTTCTC
59
AGAATGGAATGATCTCCCACC
59
GTACCACATCTCAGAATTCATCAC
59
CAGAATGGAATGATCTCCCAC
58
ACCACATCTCAGAATTCATCAC
58
GGTGACGAAGGTTTGTTACAG
59
CTCATCAATAGCTGTAACTTTCTCC
59
AATTCCAGCACTTTGGGAG
58
TCTCATTCCACATGTTGGTC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DEPDC1B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DEPDC1B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005096
Q8WUY9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8WUY9 (UniProtKB)
TAS
GO:0016477
Q8WUY9 (UniProtKB)
IMP
GO:0030177
Q8WUY9 (UniProtKB)
IMP
GO:0035556
Q8WUY9 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
Q8WUY9 (UniProtKB)
IEA
GO:0051056
Q8WUY9 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DEPDC1B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Moyamoya Disease 0.000542884 2 0 BeFree
Lip and Oral Cavity Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of mouth 0.000271442 1 0 BeFree
Moyamoya disease 1 0.000271442 1 0 BeFree
Vascular Diseases 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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