DCC (DCC netrin 1 receptor)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DCC
locus group:
protein-coding gene
location:
18q21.2
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
IGDCC1|NTN1R1
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immunoglobulin superfamily, DCC su…
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1630
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ENSG00000187323
ucsc gene id:
uc002lfe.3
refseq accession:
NM_005215
hgnc_id:
HGNC:2701
approved reserved:
1990-05-25

基因染色体位置

基因染色体位置

18q21.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

DCC（Deleted in Colorectal Cancer）基因位于人类18号染色体上，编码一种跨膜蛋白受体，属于神经生长因子受体（NGF receptor）家族中的一员，与netrin-1受体家族相关。DCC蛋白在神经系统中发挥重要作用，参与轴突导向和神经元迁移，帮助引导神经纤维向正确方向生长。此外，它在结肠和其他组织中也有表达，被认为具有抑癌作用。DCC蛋白通过与配体netrin-1结合激活下游信号通路，调控细胞黏附、迁移和凋亡。DCC基因突变或表达缺失与多种癌症密切相关，尤其是结直肠癌，其名称正是源于在结直肠癌中常发现该基因的缺失。突变可能导致DCC功能丧失，破坏细胞正常凋亡过程，促进肿瘤发生。DCC表达降低还与胃癌、胰腺癌等恶性肿瘤进展相关。过表达DCC可抑制肿瘤细胞增殖并诱导凋亡，而低表达则可能削弱其抑癌作用，导致细胞异常增殖和转移。在神经系统发育中，DCC表达异常可能影响神经回路形成，与某些神经发育障碍有关。DCC属于免疫球蛋白超家族（IgSF），该家族成员通常含有免疫球蛋白样结构域，参与细胞间识别和信号传导。DCC与同家族成员如neogenin共享部分功能，如介导细胞-细胞相互作用。DCC基因的甲基化沉默是癌症中其表达缺失的常见机制。此外，DCC单核苷酸多态性（SNP）可能与精神分裂症等神经精神疾病易感性相关。在动物模型中，DCC敲除会导致轴突导向缺陷和神经发育异常，进一步证实其在神经系统中的关键作用。

This gene encodes a netrin 1 receptor. The transmembrane protein is a member of the immunoglobulin superfamily of cell adhesion molecules, and mediates axon guidance of neuronal growth cones towards sources of netrin 1 ligand. The cytoplasmic tail interacts with the tyrosine kinases Src and focal adhesion kinase (FAK, also known as PTK2) to mediate axon attraction. The protein partially localizes to lipid rafts, and induces apoptosis in the absence of ligand. The protein functions as a tumor suppressor, and is frequently mutated or downregulated in colorectal cancer and esophageal carcinoma. [provided by RefSeq, Oct 2009]

该基因编码一个导蛋白受体。跨膜蛋白是细胞粘附分子的免疫球蛋白超家族中的一员，并介导的神经元生长锥轴突导向朝向的netrin 1配体的来源。胞质尾相互作用用酪氨酸激酶Src和粘着斑激酶（FAK，也称为PTK2）介导轴突吸引力。该PROTEIN部分定位于脂筏，并且在不存在配体诱导凋亡。蛋白质的功能作为一个肿瘤抑制，并且经常发生突变或大肠癌和食管癌下调。 [由RefSeq的，2009年10月提供]

OMIM数据库中对DCC基因的介绍     Wikipedia数据库中对DCC基因的介绍

基因序列

基因序列

DCC基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DCC基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs714       rs2256       rs16920       rs168332       rs186984       rs238422       rs347534       rs347535       rs347536       rs347537       rs347538       rs347539       rs347540       rs347541       rs347542       rs347543       rs347544      

基因表达

基因表达

DCC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGTGAGGCATCTTTAGGAG
57
CTAGACTAAGTAGGACCTGCT
58
GGGACTTTACCAATGTGAGG
58
TTTCATTGCCCTGCTACTG
58
GACTTTACCAATGTGAGGCA
58
ATATTTGCTCCTGCTACTGC
58
AGTCTCTGGAAAGCCTGTG
59
TGCTTCCTCCCACTATCTG
58
CTCCTGAAGCTTGAAGTTCC
59
CCAGAGACTGTACATTCAAACTC
59
CCTGGGCAACATATAGACCA
59
TGAGTAGCACTGTGTCTCC
59
AGTCTCTGGAAAGCCTGTG
59
TGCTTCCTCCCACTATCTG
59
TCAGCCAATGTGTATGAACAG
59
GTGATGGCATTAAGCTGCT
59
CTTTGCTTCCTGTGTCTGTG
60
CTCCATCTCCACATTGGCT
60
TCAGCCAATGTGTATGAACAG
59
GTGATGGCATTAAGCTGCT
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
SOX9
DCC
Activation
19745029

基因本体信息

DCC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DCC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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IEA
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E7EQM8 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
TAS
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
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GO:0021965
P43146 (UniProtKB)
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GO:0030424
P43146 (UniProtKB)
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GO:0033563
P43146 (UniProtKB)
IEA
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P43146 (UniProtKB)
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P43146 (UniProtKB)
IEA
GO:0048671
P43146 (UniProtKB)
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GO:0097192
P43146 (UniProtKB)
TAS
GO:1901214
P43146 (UniProtKB)
IMP
GO:2000171
P43146 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DCC基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
MIRROR MOVEMENTS 1 0.24 0 7 CLINVAR_CTD_human
Colorectal Neoplasms 0.12953026 9 2 BeFree_CTD_human_LHGDN
Colon Carcinoma 0.122442977 9 1 BeFree_CLINVAR
Malignant neoplasm of gallbladder 0.120542884 3 1 BeFree_GWASCAT
Obesity 0.12 1 1 GWASCAT
Eosinophilic esophagitis 0.12 1 1 GWASCAT
melanoma 0.12 1 0 CTD_human
Reperfusion Injury 0.08 1 0 RGD
Neuritis, Autoimmune, Experimental 0.08 1 0 RGD
Colorectal Cancer 0.014039032 44 2 BeFree_GAD

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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