CTBP1-AS (CTBP1 antisense RNA)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CTBP1-AS
locus group:
non-coding RNA
location:
4p16.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
PCAT10
alias name:
prostate cancer associated transcr…
entrez id:
285463
ensembl gene id:
ENSG00000280927
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_104331
hgnc_id:
HGNC:48337
approved reserved:
2013-06-14

基因染色体位置

基因染色体位置

4p16.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CTBP1-AS（CTBP1 Antisense RNA）是一种长链非编码RNA（lncRNA），位于人类染色体4p16.3上，与CTBP1基因（C-terminal binding protein 1）的正义链互补。CTBP1-AS通过反义调控机制影响CTBP1的表达，而CTBP1是一种转录共抑制因子，参与调控细胞增殖、分化和凋亡等过程。CTBP1-AS的主要功能是通过与CTBP1 mRNA结合，抑制其翻译或促进其降解，从而下调CTBP1蛋白的表达。CTBP1蛋白在多种生物学过程中发挥作用，包括染色质重塑、基因沉默和能量代谢调控。CTBP1-AS的异常表达与多种疾病相关，例如癌症和神经系统疾病。在癌症中，CTBP1-AS的过表达可能导致CTBP1蛋白水平下降，进而解除其对肿瘤抑制基因的抑制作用，促进肿瘤发生和发展。相反，CTBP1-AS表达降低可能导致CTBP1蛋白水平升高，增强其对细胞周期和凋亡相关基因的抑制，从而影响细胞增殖和存活。CTBP1-AS属于lncRNA家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但通过调控基因表达在多种生物学过程中发挥重要作用。lncRNA家族的共性包括参与表观遗传调控、转录调控和转录后调控，影响染色质结构、mRNA稳定性和翻译效率等。CTBP1-AS的突变可能破坏其与CTBP1 mRNA的结合能力，从而影响CTBP1的表达水平，进而改变细胞增殖和凋亡的平衡。此外，CTBP1-AS的表达水平可能受到表观遗传修饰（如DNA甲基化和组蛋白修饰）的影响，这些修饰的改变可能导致CTBP1-AS的异常表达，进而影响疾病的发生和发展。研究CTBP1-AS的功能和调控机制有助于理解其在疾病中的作用，并为相关疾病的诊断和治疗提供新的靶点。

None

无

OMIM数据库中对CTBP1-AS基因的介绍     Wikipedia数据库中对CTBP1-AS基因的介绍

基因序列

基因序列

CTBP1-AS基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CTBP1-AS基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs877987       rs900024       rs1009901       rs1045466       rs1045469       rs1045470       rs1045480       rs1250091       rs1250092       rs1250105       rs1250106       rs1265922       rs1265923       rs1680068       rs1732127       rs2306475       rs3755950      

基因表达

基因表达

CTBP1-AS基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCTGCAGATGTGAAACCT
60
GACACAGGACTCTACTTCTGG
60
GCTGCAGATGTGAAACCTG
60
GACACAGGACTCTACTTCTGG
60
CAGCTGCAGATGTGAAACC
60
CACAGGACTCTACTTCTGGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CTBP1-AS基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CTBP1-AS基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CTBP1-AS基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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