CT47A11 (cancer/testis antigen family 47 member A11)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CT47A11
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq24
gene_family:
alias symbol:
CT47.11
alias name:
cancer/testis CT47 family, member …
entrez id:
255313
ensembl gene id:
ENSG00000226929
ucsc gene id:
uc004eta.4
refseq accession:
NM_173571
hgnc_id:
HGNC:27397
approved reserved:
2009-03-09

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq24
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CT47A11属于癌症/睾丸抗原47（CT47）基因家族，该家族成员主要特征是在正常组织中仅表达于睾丸，而在多种癌症中异常表达，因此被归类为癌症-睾丸抗原（CTA）。CT47A11位于X染色体q24区域，该基因家族具有高度相似的序列和结构特征，通常包含多个外显子且编码的蛋白质含有保守结构域。CT47A11编码的蛋白可能参与生殖细胞发育或精子发生过程，其具体生物学功能尚不完全明确，但作为CTA家族成员，它在肿瘤中可能通过异常表达激活免疫应答或影响细胞增殖。研究发现CT47A11在多种恶性肿瘤（如肺癌、乳腺癌和黑色素瘤）中呈现过表达，可能与肿瘤免疫逃逸或恶性进展相关。该基因突变或表达异常可能干扰正常生殖功能，但在肿瘤中过表达时可能成为免疫治疗的潜在靶点，因其肿瘤特异性表达模式可减少对正常组织的副作用。降低CT47A11表达对机体的影响尚不清楚，但在某些癌症中可能抑制肿瘤生长。CT47基因家族的共性包括X染色体连锁、睾丸限制性表达模式以及在癌症中的再激活现象，这类基因通常通过表观遗传调控（如DNA去甲基化）在肿瘤中异常表达。目前针对CT47A11的研究仍在探索阶段，其精确分子机制和临床价值需要进一步验证。

This locus represents a member of the cancer/testis gene family 47. This family, also known as CT47, is comprised of 13 nearly identical loci clustered at Xq24. [provided by RefSeq, Sep 2010]

此轨迹表示癌症/睾丸基因家族47.这一家族的成员，也称为CT47，是由13在Xq24群集几乎相同的基因座。 [由RefSeq的，2010年9月提供]

OMIM数据库中对CT47A11基因的介绍     Wikipedia数据库中对CT47A11基因的介绍

基因序列

基因序列

CT47A11基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CT47A11基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs777664670       rs748347193       rs758694591       rs746103104       rs747144246       rs111897421      

基因表达

基因表达

CT47A11基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
AGATTTAGTGACTTCCTCTGGG
59
GGAGAAGCTCTCAGAGGAG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CT47A11基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CT47A11基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CT47A11基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Esophageal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Lung Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

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