CT47A1 (cancer/testis antigen family 47 member A1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CT47A1
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq24
gene_family:
alias symbol:
CT47.1
alias name:
cancer/testis CT47 family, member 1
entrez id:
728096
ensembl gene id:
ENSG00000236371
ucsc gene id:
uc004etn.5
refseq accession:
NM_001080146
hgnc_id:
HGNC:33282
approved reserved:
2009-03-09

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq24
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CT47A1（癌症/睾丸抗原家族47成员A1）属于CT抗原基因家族，这是一类在多种癌症中异常表达但在正常组织中仅限于睾丸和胎盘表达的基因。CT47A1位于X染色体上，其编码的蛋白质被认为可能参与肿瘤发生或免疫逃逸过程，但具体生物学功能尚不完全明确。该基因家族（CT抗原家族）的共性在于它们在多种恶性肿瘤（如黑色素瘤、肺癌、乳腺癌等）中重新激活表达，而在正常成人组织中几乎不表达（除免疫豁免组织如睾丸外），这使得它们成为癌症免疫治疗的潜在靶点。CT47A1的表达产物可能具有免疫原性，能触发T细胞或抗体反应，但其确切分子机制和相互作用蛋白仍待研究。目前未明确报道CT47A1的功能性突变对机体的直接影响，但CT抗原家族成员通常因表观遗传失调（如DNA去甲基化）在癌症中过表达，可能与肿瘤进展、转移或耐药性相关。若CT47A1过表达，可能增强肿瘤细胞的免疫逃逸能力或促进增殖；而表达降低可能减弱肿瘤的恶性表型，但具体效应需进一步验证。该基因与癌症关联性强，尤其在生殖细胞肿瘤和某些体细胞肿瘤中，但其临床意义和调控网络仍需深入探索。其他CT家族成员（如MAGE、NY-ESO-1）的研究较多，可作为参考，但CT47A1的独特性尚未完全揭示。

This locus represents a member of the cancer/testis gene family 47. This family, also known as CT47, is comprised of 13 nearly identical loci clustered at Xq24. This locus is the most telomeric of the cluster.[provided by RefSeq, Sep 2010]

此轨迹表示癌症/睾丸基因家族47.这一家族的成员，也称为CT47，是由13在Xq24群集几乎相同的基因座。这个位点集群的最端粒。[由RefSeq的，2010年9月提供]

OMIM数据库中对CT47A1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CT47A1基因的介绍

基因序列

基因序列

CT47A1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CT47A1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs778053225       rs776395912       rs776647670       rs772750235       rs772329127       rs771315749       rs771262350       rs770359802       rs769773153       rs767716553       rs768273084       rs766040097       rs765986764       rs762430311       rs758113716       rs756643153       rs756230701      

基因表达

基因表达

CT47A1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
AGATTTAGTGACTTCCTCTGGG
59
GGAGAAGCTCTCAGAGGAG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CT47A1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CT47A1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CT47A1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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