COX6C (cytochrome c oxidase subunit 6C)

symbol:
COX6C
locus group:
protein-coding gene
location:
8q22.2
gene_family:
Mitochondrial complex IV: cytochrome c oxidase subunits
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
1345
ensembl gene id:
ENSG00000164919
ucsc gene id:
uc003yiy.3
refseq accession:
NM_004374
hgnc_id:
HGNC:2285
approved reserved:
1989-05-08
8q22.2
基因染色体位置图

COX6C(细胞色素c氧化酶亚基6C)是线粒体电子传递链中细胞色素c氧化酶(COX,复合物IV)的一个亚基,属于COX基因家族。该家族编码的蛋白共同构成复合物IV的核心结构,负责将电子从细胞色素c传递至氧气,最终生成水并驱动ATP合成。COX6C作为核编码的线粒体蛋白,协助稳定复合物IV的组装并调节其活性,尤其在心肌和骨骼肌等高耗能组织中表达较高。该基因突变可能导致复合物IV功能障碍,引发线粒体疾病如Leigh综合征(表现为神经退行性变、肌无力)或心肌病,部分突变还与2型糖尿病风险相关。过表达COX6C可增强线粒体呼吸效率,但可能因过度产生活性氧(ROS)导致氧化应激;而表达降低会直接削弱氧化磷酸化,造成能量短缺,尤其影响神经和肌肉功能。COX6C与COX家族其他成员(如COX5A、COX7C)共享高度保守的跨膜结构域,共同维持复合物IV的质子通道功能。研究发现其表达水平与肿瘤代谢重编程相关,在乳腺癌中过表达可能促进癌细胞有氧糖酵解(Warburg效应)。此外,COX6C的多态性可能影响个体对高原缺氧的适应能力。

Cytochrome c oxidase, the terminal enzyme of the mitochondrial respiratory chain, catalyzes the electron transfer from reduced cytochrome c to oxygen. It is a heteromeric complex consisting of 3 catalytic subunits encoded by mitochondrial genes and multiple structural subunits encoded by nuclear genes. The mitochondrially-encoded subunits function in electron transfer, and the nuclear-encoded subunits may be involved in the regulation and assembly of the complex. This nuclear gene encodes subunit VIc, which has 77% amino acid sequence identity with mouse subunit VIc. This gene is up-regulated in prostate cancer cells. A pseudogene has been found on chromosomes 16p12. [provided by RefSeq, Jul 2010]

色素c氧化酶,线粒体呼吸链的末端酶,催化从还原细胞色素C来氧气的电子转移。它是由线粒体基因和由核基因编码的多个结构亚基编码3催化亚基异聚复合物。的线粒体编码的亚基起作用的电子转移,并且核编码亚基可能参与的复杂的调节和组装。此核基因编码亚基VIC,其中有77%的氨基酸序列同一性与小鼠亚基VIC。该基因是在前列腺癌细胞中上调。假基因已被发现在染色体16p12。 [由RefSeq的,2010年7月提供]

COX6C基因的碱基序列:[NCBI]
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COX6C基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1130474       rs1130569       rs1135382       rs4075507       rs4335107       rs4409375       rs4510829       rs4626565       rs5893499       rs7003523       rs7812991       rs7813557       rs7828241       rs7839936       rs7841162       rs7844439       rs10094411      

COX6C基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGTGGCTATAAGGGTTAATGG
58
CTTCTCAATTCTATGCCCACC
59
TGTATAAGTTTCGTGTGGCTG
59
TACCAGCCTTCCTCATCTC
58
AAGCAATGAGAGTAAGGTGTG
58
CTGACCACTCTGAATAGCCT
59
TTGTATAAGTTTCGTGTGGCTG
59
CAGCCTTCCTCATCTCCTC
59
TGTATAAGTTTCGTGTGGCTG
59
CAGCCTTCCTCATCTCCTC
59
AAGCAATGAGAGTAAGGTGTG
58
CTGACCACTCTGAATAGCC
57
      尚未收录相关数据

COX6C基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

COX6C基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004129
P09669 (UniProtKB)
IEA
GO:0005739
P09669 (UniProtKB)
IDA
GO:0005743
P09669 (UniProtKB)
TAS
GO:0006091
P09669 (UniProtKB)
TAS
GO:0006123
P09669 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
P09669 (UniProtKB)
IEA
GO:1902600
P09669 (UniProtKB)
IEA

可能调控 COX6C基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.002367032 1 0 GAD
Uterine Fibroids 0.000271442 1 0 BeFree

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