CDH3基因详情-基因数据库-基因云馆

CDH3 (cadherin 3)

symbol:: CDH3
locus group:: protein-coding gene
location:: 16q22.1
gene_family:: Major cadherins
alias symbol:: CDHP|PCAD
alias name:: P-cadherin
entrez id:: 1001
ensembl gene id:: ENSG00000062038
ucsc gene id:: uc002ewf.3
refseq accession:: NM_001793
hgnc_id:: HGNC:1762
approved reserved:: 1992-07-10

16q22.1

CDH3基因编码钙粘蛋白3（Cadherin-3），也称为胎盘钙粘蛋白（P-cadherin），属于钙粘蛋白超家族中的经典钙粘蛋白亚家族。钙粘蛋白家族是一类钙离子依赖的细胞粘附分子，主要介导细胞间的同型粘附，对组织形态发生、细胞极性和组织完整性维持至关重要。CDH3在胚胎发育过程中广泛表达，尤其在胎盘、皮肤和乳腺等上皮组织中发挥重要作用，参与细胞识别、迁移和分化等过程。CDH3蛋白通过其胞外结构域与相邻细胞上的同源钙粘蛋白结合，胞内结构域则与连环蛋白（catenin）结合，连接至细胞骨架，维持上皮组织的结构和功能。CDH3基因突变可能导致其蛋白功能异常，与多种疾病相关，如先天性厚甲症（一种皮肤角化异常疾病）和乳腺癌等。在乳腺癌中，CDH3的异常表达（尤其是过表达）与肿瘤侵袭、转移和不良预后相关，可能通过促进上皮-间质转化（EMT）增强癌细胞的迁移能力。CDH3表达降低则可能影响上皮组织的屏障功能和结构完整性，导致发育异常或组织修复障碍。此外，CDH3与其他钙粘蛋白（如E-cadherin）存在功能协同或拮抗，共同调节细胞粘附和信号传导。钙粘蛋白家族的共性包括依赖钙离子的细胞粘附功能、保守的胞外重复结构域以及与连环蛋白的结合能力，这些特性使其在发育和疾病中扮演关键角色。研究CDH3有助于理解上皮组织稳态和癌症进展的机制，并为相关疾病的诊断和治疗提供潜在靶点。

This gene is a classical cadherin from the cadherin superfamily. The encoded protein is a calcium-dependent cell-cell adhesion glycoprotein comprised of five extracellular cadherin repeats, a transmembrane region and a highly conserved cytoplasmic tail. This gene is located in a six-cadherin cluster in a region on the long arm of chromosome 16 that is involved in loss of heterozygosity events in breast and prostate cancer. In addition, aberrant expression of this protein is observed in cervical adenocarcinomas. Mutations in this gene have been associated with congential hypotrichosis with juvenile macular dystrophy. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因是从钙粘蛋白家族一个经典钙粘蛋白。所编码的蛋白质是由五个细胞外钙粘蛋白重复序列??，一个跨膜区和一个高度保守的胞质尾钙依赖性细胞 - 细胞粘着的糖蛋白。该基因位于六钙粘蛋白簇中的一个区域16号染色体的长臂即参与在乳腺癌和前列腺癌的杂合的事件的损失。此外，此蛋白的异常表达在宫颈腺癌是观察。在这种基因突变已与少年黄斑营养不良先天性少毛症相关联。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CDH3基因的介绍 Wikipedia数据库中对CDH3基因的介绍

CDH3基因的碱基序列：[NCBI]

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CDH3基因的碱基突变：仅显示部分snp

rs1075649 rs1111720 rs1111721 rs1111722 rs1124770 rs1126933 rs1886697 rs1886698 rs1886699 rs1886700 rs1886701 rs1952048 rs1952049 rs1957999 rs2094069 rs2147849 rs2147850

CDH3基因在不同组织中的表达： [UniProt]

正向引物序列

正向Tm值

反向引物序列

反向Tm值

评分

TTCTCCAGTATTCATGGGCT

59

TCTTTCCTGGACTGTCTCG

59

CCAACCCAGATGAAATCGG

59

CTGGATCCAGACTGTAGCC

59

TTGAACCAAGGAGGCAGAG

60

CTACAGCCATAAGTTGCACC

59

ACTCCCAGAAGATGACACC

58

ATGTCATAGTCCTGGTCCTC

58

TGTAGAGAAGGAGACAGGCT

60

TCACAGAAGTACCTCATACTTGG

60

CAAACGTATCTTACGAAGACAC

57

AGACTTGAGCTGATTCAGTC

57

TCCTTCTCCAGGTTTGCTG

60

CATTCCGCACAGTGAAGTC

59

ACTCCCAGAAGATGACACC

59

ATGTCATAGTCCTGGTCCTC

58

TGAACATCACGGACAAGGA

59

CTGTGTCACTCAGGTACCT

58

AATAGACGGGTCCTGAGGA

59

AATGTTTCCTTGCCTTGCG

60

转录因子

影响基因

影响类型

参考文献链接（PubMed）

BRCA1

CDH3

Repression

22120723

BRCA1

CDH3

Unknown

19882246

GATA3

CDH3

Repression

22120723

HOXA9

CDH3

Unknown

25023983

MYC

CDH3

Unknown

19882246

SP1

CDH3

Unknown

19882246

CDH3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt] [GenomeNet]

质膜
细胞质
细胞外
高尔基体
囊泡
细胞骨架
内质网
细胞核
内体
溶酶体
线粒体

CDH3基因的本体（GO）信息：

GO库代码

对应的蛋白质

来源代码

GO:0005509

J3QL41 (UniProtKB)

IEA

GO:0007156

J3QL41 (UniProtKB)

IEA

GO:0016021

J3QL41 (UniProtKB)

IEA

GO:0005509

J3QR60 (UniProtKB)

IEA

GO:0007156

J3QR60 (UniProtKB)

IEA

GO:0016020

J3QR60 (UniProtKB)

IEA

GO:0001895

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0003674

P22223 (UniProtKB)

ND

GO:0005509

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0005737

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0005886

P22223 (UniProtKB)

IDA

GO:0005886

P22223 (UniProtKB)

TAS

GO:0005886

P22223 (UniProtKB)

TAS

GO:0005913

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0007155

P22223 (UniProtKB)

TAS

GO:0007156

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0007601

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0010628

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0010838

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0016021

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0016337

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0022405

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0031424

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0032773

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0032912

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0034332

P22223 (UniProtKB)

TAS

GO:0042060

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0042493

P22223 (UniProtKB)

IEA

GO:0043568

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0048023

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0051796

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0060070

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:0060901

P22223 (UniProtKB)

IMP

GO:1902910

P22223 (UniProtKB)

IMP

可能调控 CDH3基因的相关microRNA：

hsa-miR-132 hsa-miR-335 hsa-miR-9 hsa-miR-100 hsa-miR-100*

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

序号	作用方式	资源库来源/分值	基因名称	基因名称

KEGG
Reactomepathway

名称
4514 Cell adhesion molecules (CAMs) [PATH:hsa04514]

名称
Adherens junctions interactions
Cell junction organization
Cell-Cell communication
Cell-cell junction organization

疾病名称

关系值

NofPmids

NofSnps

来源

疾病名称	关系值	NofPmids	NofSnps	来源
Ectodermal dysplasia, ectrodactyly, and macular dystrophy	0.480542884	2	2	BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
HYPOTRICHOSIS, CONGENITAL, WITH JUVENILE MACULAR DYSTROPHY	0.48	1	2	CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
Ulcerative Colitis	0.122367032	1	0	CTD_human_GAD
Ovarian Cysts	0.12	1	0	CTD_human
Squamous cell carcinoma	0.008444493	4	0	BeFree_LHGDN
Mammary Neoplasms	0.0054487	2	0	LHGDN
Hypotrichosis	0.004895885	8	0	BeFree_LHGDN
Colorectal Cancer	0.003452799	5	0	BeFree_GAD
melanoma	0.003267234	3	0	BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma	0.002995792	2	0	BeFree_LHGDN

CDH3 (cadherin 3)

基因基本信息

基因基本信息

基因染色体位置

基因染色体位置

基因简述

基因简述

基因序列

基因序列

基因突变

基因突变

基因表达

基因表达

基因引物

基因引物

转录因子

转录因子

基因本体信息

基因相关microRNA

基因相关microRNA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

基因相关服务

基因相关服务

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