CD47 (CD47 molecule)

symbol:
CD47
locus group:
protein-coding gene
location:
3q13.12
gene_family:
CD molecules|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
IAP|OA3
alias name:
antigen identified by monoclonal a…
entrez id:
961
ensembl gene id:
ENSG00000196776
ucsc gene id:
uc003dwv.2
refseq accession:
NM_001777
hgnc_id:
HGNC:1682
approved reserved:
1994-12-12
3q13.12
基因染色体位置图

CD47是一种广泛存在于细胞表面的跨膜蛋白,属于免疫球蛋白超家族(Immunoglobulin superfamily),其编码基因位于人类染色体3q13.12。CD47的主要功能是通过与信号调节蛋白α(SIRPα,一种主要在巨噬细胞和树突状细胞表达的受体)结合,发出“别吃我”(don't eat me)信号,从而抑制巨噬细胞对健康细胞的吞噬作用,维持免疫稳态。此外,CD47还参与细胞迁移、黏附、凋亡调控以及T细胞激活等过程。CD47在多种细胞类型中表达,包括红细胞、血小板、干细胞和癌细胞,其表达水平异常与多种疾病相关。在癌症中,CD47常过表达,帮助肿瘤细胞逃避免疫系统的清除,因此成为免疫治疗的靶点之一。CD47过表达会抑制巨噬细胞的抗肿瘤活性,促进肿瘤生长和转移;而降低CD47表达或阻断其与SIRPα的相互作用可增强巨噬细胞对肿瘤细胞的吞噬,提高免疫治疗效果。CD47的突变可能导致自身免疫性疾病或血液系统异常,例如CD47缺失的小鼠会出现红细胞清除加速和贫血。CD47还与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)和心血管疾病有关,可能通过调控炎症反应和细胞存活发挥作用。CD47属于免疫球蛋白超家族,该家族成员通常具有免疫球蛋白样结构域,参与细胞间识别和信号传导。CD47的功能多样性使其成为研究免疫调控、癌症治疗和炎症性疾病的重要分子。针对CD47的抗体或抑制剂(如Magrolimab)已进入临床试验,用于治疗血液肿瘤和实体瘤。需要注意的是,CD47广泛表达的特性也可能导致靶向治疗中的副作用,如贫血或血小板减少。

This gene encodes a membrane protein, which is involved in the increase in intracellular calcium concentration that occurs upon cell adhesion to extracellular matrix. The encoded protein is also a receptor for the C-terminal cell binding domain of thrombospondin, and it may play a role in membrane transport and signal transduction. This gene has broad tissue distribution, and is reduced in expression on Rh erythrocytes. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]

这个基因编码的膜蛋白,其参与该经细胞粘附发生胞外基质中的细胞内钙离子浓度的增加。所编码的蛋白质也是凝血酶的C-末端细胞结合结构域的受体,并且它可能在膜运输和信号转导的作用。这个基因具有广泛的组织分布,并在表达减少在Rh红细胞。另外剪接转录变体也发现了这种基因。 [由RefSeq的,2010年7月提供]

CD47基因的碱基序列:[NCBI]
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CD47基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs11083       rs186583       rs326341       rs326346       rs327133       rs445541       rs696364       rs697951       rs709436       rs718689       rs765090       rs765091       rs989305       rs1051050       rs1152207       rs1298251       rs1369556      

CD47基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTCTAGCACAATTACTTGGA
58
TTCTGATTGGAAGCTTGTCTC
58
TGCTTTACTTGTTGCTGGAC
59
AATGAATATTCACCTGGGACGA
60
GTGTTTAGTACAGCGATTGGA
59
ACCACAGCGAGGATATAGG
58
TATTGCGGCGTGTATACCA
59
CTAGTCCAAGTAATTGTGCTAGAG
58
TGCTTTACTTGTTGCTGGAC
59
AATGAATATTCACCTGGGACGA
60
CTATACAACCTCCTAGGAATAACTG
58
CACAAGTGTATTCCTTTCACG
58
GTATTGCGGCGTGTATACC
58
AGTCCAAGTAATTGTGCTAGAG
58
TTGCTTTACTTGTTGCTGGAC
60
ATGAATATTCACCTGGGACGA
59
CTATACAACCTCCTAGGAATAACTG
58
ACAAGTGTATTCCTTTCACGTC
59
AGCTCTAGCACAATTACTTGG
58
TCTGATTGGAAGCTTGTCTC
58
      尚未收录相关数据

CD47基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CD47基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H0YC40 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q08722 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q08722 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q08722 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q08722 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q08722 (UniProtKB)
IEA
GO:0007229
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0008228
Q08722 (UniProtKB)
IEA
GO:0008284
Q08722 (UniProtKB)
IDA
GO:0009617
Q08722 (UniProtKB)
IEA
GO:0022409
Q08722 (UniProtKB)
IDA
GO:0030198
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0050729
Q08722 (UniProtKB)
IEA
GO:0050766
Q08722 (UniProtKB)
IEA
GO:0050870
Q08722 (UniProtKB)
IDA
GO:0050900
Q08722 (UniProtKB)
TAS
GO:0070053
Q08722 (UniProtKB)
IPI
GO:0070062
Q08722 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CD47基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Autoimmune hemolytic anemia 0.006263026 4 0 BeFree_LHGDN
Liver carcinoma 0.004624443 8 0 BeFree_LHGDN
Multiple Myeloma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Hereditary spherocytosis 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Inclusion Body Myositis (disorder) 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Ischemia 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Autoimmune Diseases 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Synovitis 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Inflammation 0.00272435 1 0 LHGDN
Carcinogenesis 0.001628651 6 0 BeFree

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