CCDC110 (coiled-coil domain containing 110)

symbol:
CCDC110
locus group:
protein-coding gene
location:
4q35.1
gene_family:
alias symbol:
KM-HN-1|MGC33607|CT52
alias name:
cancer/testis antigen 52
entrez id:
256309
ensembl gene id:
ENSG00000168491
ucsc gene id:
uc003ixu.5
refseq accession:
NM_152775
hgnc_id:
HGNC:28504
approved reserved:
2006-10-23
4q35.1
基因染色体位置图

CCDC110(Coiled-Coil Domain Containing 110)是一个编码含有卷曲螺旋结构域的蛋白质的基因,其具体生物学功能尚未完全明确,但卷曲螺旋结构通常参与蛋白质相互作用、细胞骨架形成或信号转导等过程。目前研究表明,CCDC110可能在细胞分裂、纤毛形成或细胞极性维持中发挥作用,其表达产物可能与其他蛋白质结合以调控细胞形态或运动。该基因的主要作用位点可能集中在纤毛基体或中心体附近,与微管组织或细胞器定位相关。突变可能导致纤毛功能障碍,进而影响发育过程或器官功能,例如可能与某些先天性纤毛病(如多囊肾病或视网膜病变)相关。若CCDC110过表达,可能干扰正常的微管动力学或纤毛组装,导致细胞迁移异常或分裂缺陷;而表达降低可能影响纤毛稳定性,进而损害感觉功能(如嗅觉或视觉)或体液流动(如脑脊液循环)。CCDC110属于CCDC基因家族,该家族成员均含有保守的卷曲螺旋结构域,通常参与细胞骨架重组、细胞内运输或机械信号传导。家族共性包括调控细胞形态、维持细胞器定位及参与纤毛/鞭毛相关通路。目前该基因与疾病的具体关联仍需更多研究验证,但已有线索表明其可能与纤毛相关疾病或某些癌症的进展有关联。

None

CCDC110基因的碱基序列:[NCBI]
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CCDC110基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2120413       rs2120414       rs3756278       rs4862531       rs4862532       rs6552881       rs6833872       rs6841360       rs7669849       rs10574646       rs11132304       rs11352180       rs11737048       rs12650364       rs13434493       rs28465017       rs33915764      

CCDC110基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTTCAGCGTCCAAGATCC
59
CTGCTATGCAGCCATATTCTG
59
CACAATCAGCATTGAAAGTCCT
59
ATGCTGACATTCTGCAAAGTC
59
ACTTTGCAGAATGTCAGCA
58
TGATTCTCTGTAGGCAAATCC
58
TACCTTGGAATTTGAGATGCG
59
CTTGGAATTCCTTTCAAATCCG
58
GCTTCGGATTTGAAAGGTGG
60
GAGTGTCTCTGGAGCACAG
60
ACTTTGCAGAATGTCAGCA
58
TGATTCTCTGTAGGCAAATCC
58
AGAATGTCAGCATGGTACAG
57
TTCTGAGCTAAATTGTGGGT
57
TGTCAGCATGCCTACAGAG
60
GAATGAAGTGTCTTGGAATCCTC
60
AGTGACACAGGTCCTTCAG
59
TTCCGACTGTACCATGCTG
60
ACTCCGTTCTCCTTTCAGC
60
CGTTTCCTTATCTGTGTCACTG
59
      尚未收录相关数据

CCDC110基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCDC110基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
E7EUS2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
E7EUS2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
E7EUS2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
E7EUS2 (UniProtKB)
IDA
GO:0043231
E7EUS2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q8TBZ0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q8TBZ0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q8TBZ0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q8TBZ0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q8TBZ0 (UniProtKB)
IDA
GO:0043231
Q8TBZ0 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CCDC110基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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