CBR3-AS1 (CBR3 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CBR3-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
21q22.12
gene_family:
alias symbol:
PlncRNA-1
alias name:
prostate cancer-up-regulated long …
entrez id:
100506428
ensembl gene id:
ENSG00000236830
ucsc gene id:
uc061zxr.1
refseq accession:
NR_038892
hgnc_id:
HGNC:43664
approved reserved:
2012-02-08

基因染色体位置

基因染色体位置

21q22.12
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CBR3-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体21q22.11区域，与CBR3基因（羰基还原酶3）相邻并反向转录。作为非编码RNA，它不编码蛋白质，但可能通过调控邻近基因或其他靶基因的表达来发挥生物学功能。研究表明，CBR3-AS1在多种癌症中异常表达，可能参与肿瘤发生发展。例如，在肝癌中，CBR3-AS1的高表达与肿瘤进展和不良预后相关，可能通过调控细胞增殖、迁移和侵袭等过程促进癌症恶化。其作用机制可能涉及作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除miRNA对下游靶基因的抑制作用。此外，CBR3-AS1的异常表达还可能影响细胞周期和凋亡相关通路。目前关于CBR3-AS1突变的研究较少，但表观遗传修饰（如甲基化）可能调控其表达水平。降低CBR3-AS1表达可能抑制肿瘤生长，而过表达则可能促进恶性表型。CBR3-AS1属于lncRNA家族，该家族成员通常通过染色质重塑、转录调控或转录后修饰等方式参与基因表达调控，但其具体功能高度依赖上下文环境。尽管研究仍在初步阶段，CBR3-AS1的癌症相关特性使其成为潜在的诊断标志物或治疗靶点。未来研究需进一步揭示其分子机制及与其他基因或通路的相互作用网络。

None

无

OMIM数据库中对CBR3-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CBR3-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

CBR3-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CBR3-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs726271       rs879892       rs879893       rs879894       rs881711       rs881712       rs1056892       rs1541320       rs1967455       rs1967456       rs1971504       rs2003769       rs2006298       rs2027894       rs2105749       rs2105750       rs2239566      

基因表达

基因表达

CBR3-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCCTCTTCTCATCCAGACG
59
TCATCTGGGAACCTTATGGG
58
TTCCTCTTCTCATCCAGACG
59
GTAATCCCAGCACTTATGGG
58
GGAGTTCAGGACTAGCCTG
59
AGGAGAATCACCACTACCAC
58
TAATAGGGTCTTCTCTGTCGC
59
TTTCCTGAGCTCAGGAGAC
58
TCTTCCTTAGCTTCTCCGC
59
GGAATAAGCCTGCTTGTCC
58
AACTAGATGCCCTGTGAGC
59
GGAATAAGCCTGCTTGTCC
58
TTCCTCTTCTCATCCAGACG
59
ACAGAGAAGACCCTTATGGG
58
TTAAAGCTAAGGCGTGAGC
58
CTGGAGACCAGTAGCTGTC
59
GTCTTCCTTAGCTTCTCCG
57
GGATTCTGGTGAATGCGTG
59
GTTGACCAGTACGTTGAGC
58
GGAATAAGCCTGCTTGTCC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CBR3-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CBR3-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CBR3-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Benign Prostatic Hyperplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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