CASC9 (cancer susceptibility 9)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC9
locus group:
non-coding RNA
location:
8q21.13
gene_family:
alias symbol:
LINC00981|ESCCAL-1|linc-JPH1
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
101805492
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ENSG00000249395
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_103848
hgnc_id:
HGNC:48906
approved reserved:
2013-07-01

基因染色体位置

基因染色体位置

8q21.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC9（Cancer Susceptibility Candidate 9）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于非编码RNA家族中的一员。它位于人类染色体8q24.21区域，这一区域与多种癌症的发生发展密切相关。CASC9在多种肿瘤中异常表达，尤其在食管鳞状细胞癌（ESCC）、胃癌、肝癌和结直肠癌中显著高表达，表明它可能作为致癌基因发挥作用。CASC9通过调控下游靶基因的表达或与蛋白质相互作用参与肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭和凋亡抵抗等过程。例如，在食管癌中，CASC9可以通过结合某些转录因子或表观遗传修饰酶来激活Wnt/β-catenin信号通路，从而促进肿瘤进展。CASC9的突变或表达异常可能导致其功能失调，进而影响相关信号通路的正常调控，加剧肿瘤的发生和发展。如果CASC9过表达，通常会促进肿瘤细胞的恶性表型，如增强增殖能力和转移潜能；而降低CASC9表达则可能抑制肿瘤生长并诱导细胞凋亡，这使其成为潜在的癌症治疗靶点。CASC9属于长链非编码RNA家族，这一家族的成员通常不编码蛋白质，但可通过调控基因表达、染色质重塑或信号转导等机制在多种生物学过程中发挥重要作用。尽管CASC9的具体功能机制仍在研究中，但现有证据表明它在癌症发生中扮演关键角色，未来可能为癌症诊断和治疗提供新的方向。

None

无

OMIM数据库中对CASC9基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC9基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC9基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC9基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs967844       rs978598       rs978599       rs1072919       rs1074807       rs1351224       rs1351225       rs1382665       rs1382666       rs1382667       rs1382668       rs1600283       rs1817418       rs1842139       rs1871335       rs1904292       rs1912709      

基因表达

基因表达

CASC9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTGCAGTTTGATCTCAGACTG
59
AAATCACATTCTGGTTCAGAGG
59
CCTCTTTAAAGTGATTGCTCAC
58
CAAACACCAAGACCATCCA
58
CTCTCCCTCTTTAAAGTGAATGTG
60
TCAACACCATGAATGTGGC
59
CAGAAATCACCCGTCTTCTG
59
AAATCACATTCGGAGGAGC
58
CCCTCTGAACCAGAATGTG
58
TCTCAACACCATGAATGTGG
58
CTCTCCCTCTTTAAAGTGAATGTG
60
CAACACCATGAATGTGGCT
59
GGCATTGAGAAGTTAGAATGTG
58
CAACACCATGAATGTGGCT
59
AGAAATCACCCGTCTTCTG
57
AAATCACATTCGGAGGAGC
58
CCCTCTTTAAAGTGATTGCTC
57
AAACACCAAGACCATCCAG
58
GAAATCACCCGTCTTCTGC
59
AATCACATTCGGAGGAGCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC9基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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