CASC8 (cancer susceptibility 8)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC8
locus group:
non-coding RNA
location:
8q24.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
LINC00860|CARLo-1
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
727677
ensembl gene id:
ENSG00000246228
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_024393
hgnc_id:
HGNC:45129
approved reserved:
2013-07-01

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC8（Cancer Susceptibility Candidate 8）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于癌症易感性候选基因家族。该家族成员通常与肿瘤发生发展相关，并在多种癌症中表现出异常表达。CASC8的主要功能是通过调控基因表达参与细胞增殖、凋亡和转移等生物学过程。研究表明，CASC8在多种癌症中高表达，如结直肠癌、胃癌和肺癌，其过表达可能通过激活Wnt/β-catenin等信号通路促进肿瘤生长和侵袭。CASC8的作用位点主要在细胞核内，通过与转录因子或染色质修饰复合物相互作用影响下游靶基因的表达。突变或异常表达可能导致其调控功能失调，进而影响细胞周期和凋亡，增加癌症风险。例如，某些单核苷酸多态性（SNP）与CASC8表达水平变化相关，可能影响个体对癌症的易感性。降低CASC8表达可通过抑制肿瘤相关通路减缓癌细胞生长，而过表达则可能加速肿瘤进展。此外，CASC8可能与其他lncRNA或蛋白编码基因形成调控网络，共同影响癌症发生。尽管研究仍在深入，CASC8已成为潜在的癌症诊断标志物和治疗靶点。该基因家族的共性包括在肿瘤中异常表达、参与表观遗传调控及信号通路交互作用，但其具体机制因成员而异。未来研究可能进一步揭示CASC8在癌症中的精确作用及其临床应用价值。

None

None

OMIM数据库中对CASC8基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC8基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC8基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC8基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs283703       rs283704       rs283705       rs283706       rs283707       rs283714       rs283715       rs283716       rs283717       rs283718       rs283719       rs283720       rs283721       rs283722       rs283723       rs283724       rs283725      

基因表达

基因表达

CASC8基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTGACCTGAACTGTACCTG
59
TTTCTTGCAACCTGCACAG
59
AGCCAAGGAGCAATGAGAG
59
CTGGTGTATACCAGCAAGGA
59
TGACCTGAACTGTACCTGG
58
TTTCTTGCAACCTGCACAG
59
TCCTCCTTGCTGGTATACAC
58
GATGGAATTCTGTCACTTCCAC
59
GAGCTTCTTCTCTGGATCAC
57
CTTTCTTGCAACGTCAGTC
57
GACCTGAACTGTACCTGGG
59
TTTCTTGCAACCTGCACAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC8基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC8基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC8基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.12 4 1 GWASCAT
Colorectal Cancer 0.000271442 1 2 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 2 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 2 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 2 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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