CASC6 (cancer susceptibility 6)

基因基本信息

基因基本信息

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CASC6
locus group:
non-coding RNA
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6q15
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HGNC:49076
approved reserved:
2013-08-19

基因染色体位置

基因染色体位置

6q15
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC6（Cancer Susceptibility Candidate 6）是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于癌症易感性候选基因家族。该家族包含多个与癌症发生发展相关的非编码RNA基因，其共性是通过调控基因表达、染色质修饰或信号通路参与细胞增殖、凋亡和分化等过程。CASC6位于人类染色体8q24.21区域，这是一个与多种癌症（如乳腺癌、前列腺癌、结直肠癌）相关的基因组热点区域。CASC6的表达产物不编码蛋白质，而是作为lncRNA通过表观遗传调控、miRNA海绵作用或与蛋白质相互作用发挥功能。研究表明CASC6在多种癌症中异常高表达，如胃癌、肝癌和肺癌，其过表达可能通过激活Wnt/β-catenin等促癌信号通路，促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭，同时抑制凋亡。CASC6还可能与某些miRNA（如miR-26a）相互作用，解除这些抑癌miRNA对下游靶基因的抑制作用。相反，降低CASC6表达可通过抑制上皮-间质转化（EMT）过程减弱肿瘤恶性表型。该基因的突变或拷贝数变异可能影响其表达水平或功能，进而改变癌症易感性。值得注意的是，CASC6在正常组织中的表达较低，其组织特异性表达模式仍在研究中。由于8q24.21区域还包含其他重要基因如MYC，CASC6可能与该区域的基因调控网络存在协同作用。目前针对CASC6的研究仍在深入，其在癌症诊断标志物或治疗靶点方面的潜在价值值得关注。

None

无

OMIM数据库中对CASC6基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC6基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs381206       rs387722       rs407149       rs427118       rs446949       rs450512       rs479292       rs487710       rs504879       rs507428       rs510815       rs527844       rs529536       rs529607       rs533135       rs544524       rs552714      

基因表达

基因表达

CASC6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATACATACAGTTCTGCTGGCT
59
CATCCATGTCCCTCCATCC
60
TACATACAGTTCTGCTGGCT
59
CATCCATGTCCCTCCATCC
60
ACATACAGTTCTGCTGGCT
59
CATCCATGTCCCTCCATCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC6基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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