CASC22 (cancer susceptibility 22)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC22
locus group:
non-coding RNA
location:
16q12.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
TCONS_00024290|LincRNA-ENST00000515084
alias name:
None
entrez id:
283854
ensembl gene id:
ENSG00000260887
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_135281
hgnc_id:
HGNC:50627
approved reserved:
2014-05-30

基因染色体位置

基因染色体位置

16q12.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC22（Cancer Susceptibility Candidate 22）是一个近年来被研究的基因，其具体功能尚未完全阐明，但初步研究表明它可能在细胞增殖、分化和肿瘤发生中发挥作用。CASC22属于长链非编码RNA（lncRNA）家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但通过调控其他基因的表达来影响多种生物学过程。CASC22的生物学功能可能与染色质修饰、转录调控或信号通路调节相关，其表达产物通过与其他RNA、DNA或蛋白质相互作用来发挥功能。CASC22的主要作用位点可能集中在细胞核内，参与表观遗传调控或基因表达网络的调节。突变或异常表达可能影响其调控功能，导致细胞周期紊乱或促进肿瘤发展。研究表明，CASC22在某些癌症（如乳腺癌、肺癌和结直肠癌）中表达异常，可能与肿瘤的发生、侵袭或转移相关。如果CASC22过表达，可能通过激活促癌信号通路或抑制抑癌基因，促进肿瘤细胞的增殖和存活；而降低表达则可能抑制肿瘤进展或恢复正常的细胞功能调控。CASC22属于lncRNA基因家族，该家族的共性包括调控基因表达、参与细胞分化、影响免疫应答和肿瘤微环境等。由于lncRNA的多样性和复杂性，CASC22的具体机制仍需进一步研究以明确其在疾病中的作用和潜在的治疗价值。

None

无

OMIM数据库中对CASC22基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC22基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC22基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC22基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1362378       rs1477013       rs1894879       rs2387550       rs6498798       rs10521262       rs10521263       rs12325489       rs12930480       rs12932996       rs13332714       rs13336284       rs13336616       rs13339280       rs16951003       rs28480332       rs34296884      

基因表达

基因表达

CASC22基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTCCTGAAACTAGATCCCA
59
CATTGGTCCTGAATTCCGC
59
ATACTGCAGAGATCCCAGAC
59
GCTCATTGGTCCTGAATTCC
59
TCCTGAAACTAGATCCCAGAC
59
CTCATTGGTCCTGAATTCCG
59
AATACTGCAGAGATCCCAGAC
59
CTCATTGGTCCTGAATTCCG
59
AGAAATACTGCAGAGATCCCA
59
ATTGGTCCTGAATTCCGCT
59
AGCTCCTGAAACTAGATCCC
59
ATTGGTCCTGAATTCCGCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC22基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC22基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC22基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 1 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 1 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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