CASC2 (cancer susceptibility 2)

symbol:
CASC2
locus group:
non-coding RNA
location:
10q26.11
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
255082
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ENSG00000177640
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uc001ldm.5
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NR_026939
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HGNC:22933
approved reserved:
2003-07-23
10q26.11
基因染色体位置图

CASC2(Cancer Susceptibility Candidate 2)是一种长链非编码RNA(lncRNA)基因,属于CASC基因家族的一员。该家族成员通常具有调控细胞增殖、凋亡和分化等功能,并在多种癌症中发挥重要作用。CASC2的主要生物学功能是通过调控下游信号通路影响肿瘤的发生发展,特别是作为肿瘤抑制基因发挥作用。它能够通过结合微小RNA(miRNA)或与其他蛋白质相互作用,调节关键信号通路如Wnt/β-catenin、PI3K/AKT和MAPK等,从而抑制肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。CASC2的表达产物本身不编码蛋白质,而是通过RNA分子直接参与基因表达的调控。CASC2在多种组织中表达,但在某些癌症如胶质瘤、肺癌和结直肠癌中表达水平显著降低。CASC2的突变或表达异常可能导致其肿瘤抑制功能丧失,从而促进肿瘤的发生和发展。例如,CASC2的低表达与肿瘤的恶性程度、预后不良以及化疗耐药性增加相关。研究表明,CASC2的过表达可以抑制肿瘤细胞的生长并诱导凋亡,而降低表达则会促进肿瘤的进展。此外,CASC2还参与调控炎症反应和免疫微环境,可能通过影响免疫细胞的活性间接抑制肿瘤。CASC2基因家族的共性在于其成员多为lncRNA,具有广泛的调控功能,尤其在癌症中扮演重要角色。家族成员通常通过表观遗传修饰、转录调控或信号通路干预等方式影响细胞命运。CASC2作为该家族的代表之一,其功能研究为理解lncRNA在肿瘤中的作用提供了重要线索。未来,针对CASC2的调控可能成为癌症治疗的新策略。

None

CASC2基因的碱基序列:[NCBI]
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CASC2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1369       rs703422       rs703423       rs703424       rs703425       rs853565       rs853566       rs853567       rs853569       rs853575       rs853576       rs853577       rs853578       rs853579       rs853580       rs853581       rs853582      

CASC2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTGCATGAATTTCTAAGAGCC
58
CAGATGAGGGTACATCTTCTCC
60
CCTATTCCGAGTAAGAAGTGTG
58
CCAGCTTTAGAAATGTCCAGTG
60
AGCTTCTAAGGGTACATAAGAC
57
TCTTCTCCTGTGTCATGCA
59
GATGGAGATTCAGAAACATAAGGAC
60
ACACTTCTTACTCGGAATAGGG
59
GCATGAATTTCTAAGGTCTCTG
57
GATCCGAAATGCTTCATGC
58
CCAGTCCAATAAAGGTTGGA
58
TTTCTGGCTAATAGGTCTCAC
57
GCATGAATTTCTAAGAGCCAG
57
CATCTCCAGTGAATAAGTTGC
57
GTTGCATGAATTTCTAAGAGCC
58
CTGTGTTGATGTTGATTTGCAC
59
TCTGGAGAAACACAGAGGC
59
GTTTCTGAATCTCCATCGGG
59
CCTATTCCGAGTAAGAAGTGTG
58
CCCATCTCCAGACTTGTGAG
60
      尚未收录相关数据

CASC2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC2基因的本体(GO)信息:

可能调控 CASC2基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Endometrial Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Endometrial Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Uterine Corpus Cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of endometrium 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Glioma 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

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