CASC19 (cancer susceptibility 19)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC19
locus group:
non-coding RNA
location:
8q24.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
CARLo-6
alias name:
None
entrez id:
103021165
ensembl gene id:
ENSG00000254166
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_120364
hgnc_id:
HGNC:49476
approved reserved:
2013-12-18

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC19（Cancer Susceptibility Candidate 19）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于癌症易感性候选基因家族。该家族成员通常与肿瘤发生发展相关，并在多种癌症中表现出异常表达模式。CASC19位于人类染色体8q24.21区域，这是一个包含多个癌基因和lncRNA的基因组热点区域。CASC19在多种癌症中发挥重要作用，其表达水平与肿瘤进展、转移和患者预后密切相关。研究表明CASC19在结直肠癌、肺癌、乳腺癌等多种恶性肿瘤中高表达，可能通过调控细胞周期、增殖、凋亡和上皮-间质转化（EMT）等过程促进肿瘤发展。CASC19的生物学功能主要通过与microRNA或蛋白质相互作用来实现，例如它可以作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附miR-140-5p，从而解除miR-140-5p对其靶基因的抑制作用，促进肿瘤细胞增殖和侵袭。CASC19的突变或表达异常可能导致其调控网络紊乱，进而影响肿瘤发生发展。当CASC19过表达时，可能促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭能力，抑制细胞凋亡，并与不良预后相关；而降低CASC19表达则可能抑制肿瘤进展。CASC19与Wnt/β-catenin、PI3K/AKT等关键信号通路相互作用，这些通路在肿瘤发生中起重要作用。此外，CASC19可能通过表观遗传调控影响其他基因表达。作为lncRNA基因家族成员，CASC19与其他家族成员共享一些共性特征，如长度超过200个核苷酸、缺乏显著蛋白编码能力、通过RNA分子本身发挥调控功能等。这类基因通常具有组织特异性表达模式，并在多种生理和病理过程中发挥重要调控作用。目前对CASC19的研究仍在深入，其在癌症诊断和治疗中的潜在应用价值值得进一步探索。

None

None

OMIM数据库中对CASC19基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC19基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC19基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC19基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1020700       rs1021954       rs1021955       rs1378902       rs1473581       rs2456453       rs2456454       rs2456455       rs2466028       rs2466029       rs2466030       rs2466031       rs2466032       rs2466033       rs2466034       rs2466035       rs2466036      

基因表达

基因表达

CASC19基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTGTCCAAACTGACTGTG
59
GAAGCTGATAGTGATTCTGCC
59
TGCTTACTGCATGCTTCTG
59
GGAAGCTAGAGTGTTCTCCT
59
GCTGTCCAAACTGACTGTG
59
AAGCTGATAGTGATTCTGCCA
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC19基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC19基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC19基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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