CASC18 (cancer susceptibility 18)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC18
locus group:
non-coding RNA
location:
12q23.3
gene_family:
alias symbol:
LOC101929110
alias name:
None
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101929110
ensembl gene id:
ENSG00000257859
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None
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NR_110108
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HGNC:49463
approved reserved:
2013-12-03

基因染色体位置

基因染色体位置

12q23.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC18（Cancer Susceptibility Candidate 18）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于癌症易感性候选基因家族。该家族成员通常与肿瘤发生发展相关，通过调控基因表达、细胞周期或信号通路参与癌症进程。CASC18在多种癌症中异常表达，其生物学功能主要涉及调控细胞增殖、迁移和侵袭。研究表明，CASC18在结直肠癌、胃癌等恶性肿瘤中常呈现过表达，可能通过作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除miRNA对下游靶基因的抑制作用，促进肿瘤进展。例如，CASC18可能通过吸附miR-193a-5p来上调WT1表达，激活Wnt/β-catenin信号通路，进而加速癌细胞增殖和转移。CASC18的突变或表达异常可能破坏其正常调控网络，导致细胞失控生长。降低CASC18表达可通过抑制相关信号通路减缓肿瘤恶性行为，而过表达则可能增强癌细胞的侵袭性。此外，CASC18还与某些癌症的临床特征（如分期、预后）相关，可能成为潜在的诊断标志物或治疗靶点。该基因家族成员普遍具有组织特异性表达模式，并在表观遗传调控、染色质重塑等过程中发挥作用，但各成员的具体机制和靶点可能存在差异。目前对CASC18的研究仍在深入，其在其他生理病理过程中的功能有待进一步阐明。

None

None

OMIM数据库中对CASC18基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC18基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC18基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC18基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1819502       rs1962255       rs2374530       rs2374531       rs2374532       rs2374542       rs2374543       rs2374544       rs2374548       rs2888873       rs3741635       rs3741636       rs3741637       rs3863380       rs3863381       rs4130169       rs4132336      

基因表达

基因表达

CASC18基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAGGGCAAAGAAGAAAGTG
59
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
ATTAGAGTCTGTAGTTAAGGCCC
60
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
GAGGGCAAAGAAGAAAGTGC
60
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
TTAGAGTCTGTAGTTAAGGCCC
59
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
CCCAATTAGAGTCTGTAGTTAAGG
59
GCATTGATAACTAACTCTGCTG
58
GCAAAGAAGAAAGTGCTTTGG
59
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC18基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC18基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC18基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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