CASC17 (cancer susceptibility 17)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC17
locus group:
non-coding RNA
location:
17q24.3
gene_family:
alias symbol:
LINC00600
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
101928165
ensembl gene id:
ENSG00000260785
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_104152
hgnc_id:
HGNC:43911
approved reserved:
2013-08-19

基因染色体位置

基因染色体位置

17q24.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC17（癌症易感性候选基因17）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于癌症易感性候选基因（CASC）家族。该家族成员通常位于基因组中与癌症相关的区域，具有调控基因表达的功能，尤其在肿瘤发生发展中可能发挥重要作用。CASC17的生物学功能尚未完全明确，但研究表明它可能参与细胞增殖、分化和凋亡等过程的调控。其表达产物作为lncRNA，不编码蛋白质，但可通过表观遗传调控、转录调控或作为竞争性内源RNA（ceRNA）影响其他基因的表达。CASC17的主要作用位点可能涉及染色质修饰复合物或特定mRNA的相互作用。突变或异常表达可能破坏其调控网络，导致细胞周期紊乱或肿瘤发生。研究发现CASC17在多种癌症中表达异常，如乳腺癌、胃癌和结直肠癌，可能作为癌基因或抑癌基因发挥作用。过表达CASC17可能促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭，而降低表达则可能抑制这些恶性表型。CASC17可能通过调控关键信号通路（如Wnt/β-catenin或PI3K/AKT）影响癌症进展。该基因家族成员通常具有组织特异性表达模式，并在癌症中呈现差异表达，可能作为诊断标志物或治疗靶点。由于lncRNA功能的复杂性，CASC17的具体机制仍需进一步研究以明确其在生理和病理过程中的精确作用。

None

无

OMIM数据库中对CASC17基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC17基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC17基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC17基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs719615       rs723338       rs740408       rs758106       rs767203       rs956218       rs956219       rs984434       rs988469       rs991429       rs991528       rs1008348       rs1011729       rs1011730       rs1013999       rs1014000       rs1468481      

基因表达

基因表达

CASC17基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGGACATAAGGAGACGGG
60
GTTGATCTCACTGGGAGCT
59
AGTGGACATAAGGAGACGG
59
TTGATCTCACTGGGAGCTG
59
GTGGACATAAGGAGACGGG
60
TTGATCTCACTGGGAGCTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC17基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC17基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC17基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.12 5 2 GWASCAT
Pulmonary function (finding) 0.12 1 1 GWASCAT

基因相关服务

基因相关服务

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