CASC15 (cancer susceptibility 15)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC15
locus group:
non-coding RNA
location:
6p22.3
gene_family:
alias symbol:
lnc-SOX4-1
alias name:
None
entrez id:
401237
ensembl gene id:
ENSG00000272168
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_015410
hgnc_id:
HGNC:28245
approved reserved:
2011-08-10

基因染色体位置

基因染色体位置

6p22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CASC15（Cancer Susceptibility Candidate 15）是一种长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于癌症易感性候选基因家族。该基因家族成员通常与肿瘤发生发展相关，具有调控细胞增殖、分化和凋亡的功能。CASC15位于人类染色体6p22.3区域，其表达产物不编码蛋白质，而是通过RNA分子本身发挥作用。研究表明，CASC15在多种癌症中异常表达，尤其在神经母细胞瘤、肺癌和结直肠癌中表现显著。该基因主要通过表观遗传调控、miRNA海绵作用或与蛋白质相互作用来影响下游信号通路，如Wnt/β-catenin和MAPK通路。CASC15的突变可能导致其调控功能异常，进而促进肿瘤细胞的恶性转化和转移。当CASC15过表达时，可能促进肿瘤细胞增殖、侵袭和转移，抑制凋亡；而降低表达则可能抑制肿瘤进展。此外，CASC15还参与胚胎发育和神经系统的正常功能，其异常表达可能影响这些生理过程。该基因与神经母细胞瘤的预后密切相关，高表达通常提示不良预后。CASC15作为lncRNA基因家族的成员，具有该家族的典型特征：长度超过200nt、缺乏蛋白编码能力、通过RNA分子直接发挥作用，并参与基因表达的精细调控。

None

无

OMIM数据库中对CASC15基因的介绍     Wikipedia数据库中对CASC15基因的介绍

基因序列

基因序列

CASC15基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC15基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2686       rs3406       rs17491       rs169031       rs171900       rs182017       rs183184       rs185498       rs189877       rs196021       rs196022       rs196023       rs196024       rs196025       rs196026       rs196027       rs196028      

基因表达

基因表达

CASC15基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCCTTAGAACTTCAAAGCTG
57
GAACCGCTAATTACAAGCTG
57
AAGGAACTGATGGGCTAGG
59
TCTGGTCTCCAGAACTTAACC
59
TGCTTCTGATTCTACATCTCC
57
TACTCTTCTTGGCTGAGGT
57
ACTACAGATGTGTTAACACCC
58
TTGCCATGATTCACACCTG
59
AACAGTATGGGCTCACAGG
59
TAAAGAAATCAAGCCTGCCC
59
GTAAAGCAAAGTCTTCAAGGG
58
TATTGCCATGATTCACACTAGG
58
TTTGCAACAGTATGGTTCTCG
59
AGGTTGAGACTGCACTGAC
60
CCTTGCTTCTGATTCTACATCTC
59
CTTCTTGGCTGAGGTTGTG
58
CCCTCTGAATAGCTTCTAGTG
57
TCTGAATCTACAACAAGCCTC
58
GGTAAAGCAAAGTCTTCAAGG
58
ATTGCCATGATTCACACTAGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC15基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC15基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC15基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neuroblastoma 0.12554839 6 3 BeFree_GAD_GWASCAT
Pulmonary function (finding) 0.12 2 2 GWASCAT
Hepatitis 0.12 1 1 GWASCAT
Neoplastic Cell Transformation 0.002367032 1 0 GAD
Central neuroblastoma 0.000814326 3 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Metastatic melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Metastatic malignant neoplasm to brain 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Xenograft Model 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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