CALB2 (calbindin 2)

symbol:
CALB2
locus group:
protein-coding gene
location:
16q22.2
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
CAL2
alias name:
calretinin
entrez id:
794
ensembl gene id:
ENSG00000172137
ucsc gene id:
uc002faa.6
refseq accession:
NM_001740
hgnc_id:
HGNC:1435
approved reserved:
1990-09-10
16q22.2
基因染色体位置图

CALB2(Calbindin 2,中文常译为钙结合蛋白2)是一种属于钙结合蛋白(Calcium-binding proteins)基因家族的成员,该家族还包括CALB1(Calbindin 1)等。钙结合蛋白家族的主要共性是能够结合钙离子(Ca²⁺),参与细胞内钙信号的调节,从而影响神经传递、肌肉收缩、细胞增殖等多种生理过程。CALB2编码的蛋白质是一种EF-hand型钙结合蛋白,其结构中含有特定的EF-hand结构域(一种螺旋-环-螺旋的蛋白质结构,能够特异性结合钙离子),这使得它能够高效地缓冲细胞内钙离子浓度,防止钙超载导致的细胞损伤。CALB2主要在中枢神经系统(如大脑皮层、海马、小脑等)和周围神经系统中表达,尤其在抑制性神经元(如GABA能神经元)中含量较高,参与调节神经元的兴奋性和突触可塑性(指突触连接强度可随活动而改变的特性)。此外,CALB2也在肾脏、肠道等组织中表达,可能与钙的吸收和转运有关。CALB2的突变或表达异常与多种神经系统疾病相关。例如,CALB2表达降低可能与癫痫、帕金森病和阿尔茨海默病等神经退行性疾病有关,因为其钙缓冲功能的减弱会导致神经元更容易受到钙依赖性毒性损伤。另一方面,CALB2的过表达在某些癌症(如神经内分泌肿瘤)中被观察到,可能与肿瘤细胞的钙信号通路异常激活有关。在基因功能方面,CALB2的过表达可能增强神经元的钙缓冲能力,减少兴奋性毒性(指过度兴奋导致的神经元损伤),但过度表达也可能干扰正常的钙信号传导,影响突触功能。相反,CALB2表达降低会使神经元对钙离子波动更敏感,可能增加癫痫发作风险或加速神经退行性病变的进程。此外,CALB2与其他钙结合蛋白(如Parvalbumin)功能上有部分重叠,但在分布和具体作用上存在差异。例如,CALB2更多分布于抑制性中间神经元,而Parvalbumin在快发放中间神经元中占主导。这种分布差异使得它们在神经环路中发挥不同的调控作用。研究还发现,CALB2的表达可能受维生素D受体(VDR)等转录因子调控,提示其与钙代谢的激素调节存在关联。

This gene encodes an intracellular calcium-binding protein belonging to the troponin C superfamily. Members of this protein family have six EF-hand domains which bind calcium. This protein plays a role in diverse cellular functions, including message targeting and intracellular calcium buffering. It also functions as a modulator of neuronal excitability, and is a diagnostic marker for some human diseases, including Hirschsprung disease and some cancers. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2010]

None

CALB2基因的碱基序列:[NCBI]
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CALB2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs746732       rs889704       rs1800642       rs1862818       rs2004142       rs3935259       rs4291906       rs4327058       rs4404075       rs4412976       rs4438314       rs4511543       rs4630548       rs4788542       rs4788543       rs4788797       rs4788798      

CALB2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCAGAGATGTCCCGACTC
59
TTAAACTCCTCTGAGGTCAGC
60
TACATTGACGAGCATGAGC
58
TTCTGTAGTTGGTGAGCTG
57
CCTCTCAGAGATACTCCTGC
59
TTAAACTCCTCTGAGGTCAGC
60
TCAGACCTGCTGAAGAAGG
59
GCTTCTATCCGGGACATCTC
60
AGCTCAAGGGATTCCTGTC
59
GTTTGGGTGTATTCCTGGAG
58
CTCAGAGATGTCCCGACTC
59
TTAAACTCCTCTGAGGTCAGC
60
CTCAGAGATGTCCCGACTC
59
TAAACTCCTCTGAGGTCAGC
59
CTCAGAGATGTCCCGACTC
59
TAAACTCCTCTGAGGTCAGC
59
GCCTCTCAGAGATACTCCTG
59
TAAACTCCTCTGAGGTCAGC
59
TCAGACCTGCTGAAGAAGG
59
AAACATCCGTAGTATGGTTTGG
58
      尚未收录相关数据

CALB2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CALB2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
A6NER6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
A6NER6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005509
H3BMN5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
H3BN14 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
P22676 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
P22676 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
P22676 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
P22676 (UniProtKB)
IBA
GO:0005921
P22676 (UniProtKB)
IEA
GO:0043005
P22676 (UniProtKB)
IBA
GO:0043195
P22676 (UniProtKB)
IEA
GO:0045202
P22676 (UniProtKB)
IBA
GO:0051480
P22676 (UniProtKB)
IBA

可能调控 CALB2基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS 1 0.12 1 0 CTD_human
Uveitis 0.12 1 0 CTD_human
Ameloblastoma 0.005720142 2 0 BeFree_LHGDN
Myxoma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Colonic Neoplasms 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
polyps 0.00272435 1 0 LHGDN
Medullary carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Hyperplasia 0.00272435 1 0 LHGDN
Mesothelioma 0.002442977 9 0 BeFree
Carcinogenesis 0.001357209 5 0 BeFree

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