BCAR4 (breast cancer anti-estrogen resistance 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
BCAR4
locus group:
non-coding RNA
location:
16p13.13
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None
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400500
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uc059qxb.1
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HGNC:22170
approved reserved:
2006-05-09

基因染色体位置

基因染色体位置

16p13.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

BCAR4（Breast Cancer Anti-Estrogen Resistance 4）是一种长链非编码RNA（lncRNA），主要与乳腺癌的抗雌激素治疗耐药性相关。它在多种癌症中表达异常，尤其在乳腺癌中高表达，与肿瘤进展、转移和不良预后密切相关。BCAR4通过调控多个信号通路（如HER2/EGFR和Wnt/β-catenin通路）促进癌细胞增殖、侵袭和转移。其表达产物虽不编码蛋白质，但可作为分子支架或竞争性内源RNA（ceRNA）与其他RNA或蛋白质相互作用，影响基因表达网络。突变或异常表达可能导致信号通路失调，加剧肿瘤恶性表型。BCAR4过表达会增强癌细胞对内分泌治疗的抵抗，而降低其表达可抑制肿瘤生长并提高治疗敏感性。它属于一个较大的lncRNA家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但通过表观遗传调控、转录干扰或信号通路调制等机制广泛参与细胞生理和病理过程。BCAR4与家族成员的共性是能在染色质重塑、转录后调控及细胞间通讯中发挥作用，但其具体功能具有基因特异性。研究BCAR4有助于开发针对耐药性乳腺癌的靶向治疗策略。

This gene produces a spliced long non-coding RNA (lncRNA) that has been implicated in breast cancer metastasis. It was originally identified in a screen for genes responsible for the development of resistance to anti-estrogens in breast cancer cells. It is thought that release of CCL21 enables this lncRNA to bind to the SNIP1 and PNUTS transcription factors, thereby activating a non-canonical GLI-dependent hedgehog signaling pathway that promotes cancer cell migration and invasion. A similar gene in cow expresses a protein in mature oocytes and preimplantation embryos. Alternatively spliced transcript variants have been identified. [provided by RefSeq, Apr 2015]

该基因产生已在乳腺癌转移被牵连拼接长链非编码RNA（lncRNA）。它在对负责抗性的发展，以在乳腺癌细胞中的抗雌激素基因的屏幕最初被鉴定。据认为，CCL21的释放使此lncRNA绑定到SNIP1和PNUTS转录因子，从而激活一个非经典的GLI依赖性hedgehog信号传导途径，促进癌细胞的迁移和侵袭。在奶牛类似的基因表达成熟的卵母细胞和植入前胚胎的蛋白质。可变剪接转录物变体也已确定。 [由RefSeq的，2015年4月提供]

OMIM数据库中对BCAR4基因的介绍     Wikipedia数据库中对BCAR4基因的介绍

基因序列

基因序列

BCAR4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

BCAR4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs718080       rs718081       rs1128835       rs1128837       rs2098338       rs4429311       rs4493057       rs4561483       rs4780403       rs4781155       rs4781156       rs4781157       rs4781158       rs6498250       rs7185565       rs7189510       rs7193470      

基因表达

基因表达

BCAR4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCAACTGAAAGCCAACCA
59
ATAAGGTCAGGAATAGTTTCCC
57
AACTGAAAGCCAACCAGGT
59
AACACGGATTCTCACAAGC
58
AACTGAAAGCCAACCAGGA
59
TGGATAGGTTGGTACATGGT
58
TCTGAATGTCTGCTTGTCAC
58
CAACAATGAGTCCCAGAATCAC
60
ATGAAATGGTCAACTGAAAGCC
60
GTTTGGATAGGTTGGTACATGG
59
CTGTACCAGGGTCTTGTCC
59
CTTGAACCCAGGAGATGGA
59
TTCTCCCTTGGGTCTTGTC
59
CTTGAACCCAGGAGATGGAG
60
GGTGAACCAAATGAAATGGTC
58
AATTCACTTCTCACAAGGAGAG
58
AAGTATCTGGGACTACAGCA
57
TCCATGGATAAGTTTGGATAGG
57
TCAACTGAAAGCCAACCAG
58
ATTACGCCATTGTATTCCAGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

BCAR4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BCAR4基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 BCAR4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.123267234 3 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Breast Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001357209 5 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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