ARX (aristaless related homeobox)

symbol:
ARX
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp21.3
gene_family:
X-linked mental retardation|PRD class homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
ISSX|CT121|EIEE1
alias name:
cancer/testis antigen 121
entrez id:
170302
ensembl gene id:
ENSG00000004848
ucsc gene id:
uc004dbp.5
refseq accession:
NM_139058
hgnc_id:
HGNC:18060
approved reserved:
2002-02-11
Xp21.3
基因染色体位置图

ARX(Aristaless-related homeobox)基因属于ARX基因家族,该家族主要编码含有同源结构域的转录因子,在胚胎发育中起关键作用,尤其在神经系统和生殖系统的发育中扮演重要角色。ARX基因位于X染色体上(Xp22.13),其编码的蛋白质含有多个功能域,如同源结构域(负责DNA结合)和富含脯氨酸的结构域(参与蛋白质相互作用)。ARX的主要功能是调控神经前体细胞的增殖、迁移和分化,特别是在大脑皮层、基底节和胰腺发育中起核心作用。ARX基因突变会导致多种严重的神经系统疾病,包括X连锁智力障碍(如West综合征和Partington综合征)、无脑回畸形(lissencephaly)以及婴儿痉挛症。这些突变通常影响ARX的DNA结合能力或蛋白质相互作用,导致神经发育异常。例如,最常见的突变类型是重复扩增(如GCG重复),会导致蛋白质功能丧失或异常,进而干扰神经元的正常分化和迁移。ARX基因的过表达可能导致神经前体细胞过度增殖,而表达降低则可能引起神经元分化障碍或迁移缺陷。此外,ARX还与其他基因(如DLX家族基因)相互作用,共同调控GABA能神经元的发育。ARX基因家族的共性在于它们都含有同源结构域,参与发育过程中的基因表达调控,尤其在神经系统和器官形成中具有保守功能。ARX的异常表达或突变不仅影响神经系统,还与胰腺发育异常(如新生儿糖尿病)有关。研究ARX基因有助于理解神经发育疾病的机制,并为相关治疗提供潜在靶点。

This gene is a homeobox-containing gene expressed during development. The expressed protein contains two conserved domains, a C-peptide (or aristaless domain) and the prd-like class homeobox domain. It is a member of the group-II aristaless-related protein family whose members are expressed primarily in the central and/or peripheral nervous system. This gene is thought to be involved in CNS development. Mutations in this gene cause X-linked mental retardation and epilepsy. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因是发育过程中表达了含同源基因。表达的蛋白含有两个保守结构域,一个C肽(或aristaless域)和珠三角一样类同源框结构域。它是基团 - 二aristaless相关蛋白家族的成员主要表达于中枢和/或外周神经系统中的一员。该基因被认为是参与中枢神经系统的发展。突变这个基因导致X连锁智力低下和癫痫。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ARX基因的碱基序列:[NCBI]
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ARX基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs781186330       rs781348930       rs781604708       rs781097062       rs780952342       rs780943837       rs780863395       rs780935343       rs780689363       rs780812117       rs780549808       rs780415621       rs780368918       rs780315104       rs780347170       rs780261003       rs779870444      

ARX基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ARX
KDM5C
Unknown
ARX
LMO1
Unknown
ARX
PAX4
Unknown
ARX
SHOX2
Unknown

ARX基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ARX基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000980
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000981
Q96QS3 (UniProtKB)
IDA
GO:0001206
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003682
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0010628
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0021759
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0021800
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0021831
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0021846
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0021853
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0042127
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0044241
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0046622
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0072148
Q96QS3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ARX基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
EPILEPTIC ENCEPHALOPATHY, EARLY INFANTILE, 1 0.56 1 8 CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Lissencephaly, X-Linked, 2 0.56 2 23 CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Proud Syndrome 0.48 1 2 CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
PARTINGTON X-LINKED MENTAL RETARDATION SYNDROME 0.360814326 3 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
MENTAL RETARDATION, X-LINKED, WITH OR WITHOUT SEIZURES, ARX-RELATED (disorder) 0.36 1 3 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
West Syndrome 0.146137872 21 0 BeFree_LHGDN_ORPHANET
Early infantile epileptic encephalopathy with suppression bursts 0.121900093 7 1 BeFree_ORPHANET
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.08 1 0 RGD
Intellectual Disability 0.023694895 15 0 BeFree_LHGDN
Mental Retardation, X-Linked 0.01659768 21 1 BeFree_LHGDN

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山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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E-mail: product@genelibs.com

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