ADAMTS1 (ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1)

symbol:
ADAMTS1
locus group:
protein-coding gene
location:
21q21.3
gene_family:
ADAM metallopeptidases with thrombospondin type 1 motif
alias symbol:
C3-C5|METH1|KIAA1346
alias name:
metalloprotease and thrombospondin…
entrez id:
9510
ensembl gene id:
ENSG00000154734
ucsc gene id:
uc002ymf.4
refseq accession:
NM_006988
hgnc_id:
HGNC:217
approved reserved:
1998-11-19
21q21.3
基因染色体位置图

ADAMTS1(A Disintegrin And Metalloproteinase with Thrombospondin Motifs 1)属于ADAMTS基因家族,这是一个由19个成员组成的分泌型金属蛋白酶家族,主要功能是降解细胞外基质(ECM)并参与多种生理和病理过程。ADAMTS家族成员的共性包括:含有前导肽、金属蛋白酶结构域、去整合素样结构域、血小板反应蛋白1型重复序列(TSR)以及一个或多个辅助结构域,这些结构域赋予它们特定的底物识别能力和功能多样性。ADAMTS1最初因其在炎症和血管生成中的作用而被发现,它能够切割多种ECM成分,如聚集蛋白聚糖(aggrecan)和versican,从而影响组织重塑和细胞迁移。ADAMTS1的主要作用位点包括发育中的组织、血管系统和炎症部位,尤其在卵巢、心脏和软骨中表达较高。该基因的突变可能导致功能丧失或异常,与多种疾病相关,例如骨关节炎(由于ECM降解异常)、肿瘤转移(通过调节血管生成和细胞侵袭)以及心血管疾病(如动脉粥样硬化,因其影响血管壁稳定性)。ADAMTS1过表达可能促进肿瘤进展和转移,因为它能增强ECM降解并释放促血管生成因子;同时,它也可能抑制血管生成,具体效果取决于微环境。降低ADAMTS1表达可能导致组织修复障碍、血管发育异常或炎症反应失调。此外,ADAMTS1与其他基因(如VEGF、TGF-β)相互作用,调节血管生成和纤维化过程。在卵巢中,ADAMTS1参与排卵过程,其表达受激素调控。总之,ADAMTS1是一个多功能基因,其表达水平或功能异常与多种疾病密切相关,尤其在ECM代谢和血管生物学中发挥关键作用。

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motif) protein family. Members of the family share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The protein encoded by this gene contains two disintegrin loops and three C-terminal TS motifs and has anti-angiogenic activity. The expression of this gene may be associated with various inflammatory processes as well as development of cancer cachexia. This gene is likely to be necessary for normal growth, fertility, and organ morphology and function. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码的ADAMTS的成员(去整合素和金属蛋白酶与血小板序)蛋白质家族。家庭共享几个不同的蛋白质模块的成员,包括一个前肽区,金属蛋白酶结构域,一个去整合素样结构域,和一个血小板1型(TS)的基序。这个家庭的各个成员在C端TS图案的数量不同,有的有独特的C端结构域。由该基因编码的蛋白质含有两个整合素环和三个C末端的TS基序,并具有抗血管生成活性。该基因的表达可以与各种炎症过程以及癌症恶病质的发展相关联。该基因可能对正常生长,生育,和器官的形态和功能是必需的。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ADAMTS1基因的碱基序列:[NCBI]
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ADAMTS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2738       rs8992       rs12140       rs13615       rs229041       rs229042       rs229043       rs370850       rs390955       rs392840       rs400852       rs402007       rs408358       rs409630       rs416905       rs417301       rs420742      

ADAMTS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACCAGACAGGACTTGTG
59
TCTTCTATGACGGAGCAGC
59
AACCTTGAGGACTGTCCAG
59
GTGCTTCACATTGTTCCTCTC
60
ATCCACGATGAACAGAAGGG
60
ACACAAGTCCTGTCTGGTG
60
CCATGAATTAGGCCACGTG
59
TGTGGGAATCCTGGTTCAC
60
TCACTTTGGAACTGGAAGCA
60
AATTCTGCCATCGACTGGT
59
TCTCACCAAAGGACAGGTG
59
ACCATCTACAACCTTGGGC
60
TCTCACCAAAGGACAGGTG
59
ACCATCTACAACCTTGGGC
60
TACTGTGAAGGCAAACGAG
58
TCCATTATTGTCTGGACAGTC
58
CCATGAATTAGGCCACGTG
59
TGGGAATCCTGGTTCACAC
60
TCCACGATGAACAGAAGGG
59
ACACAAGTCCTGTCTGGTG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ERG
ADAMTS1
Activation
EZH2
ADAMTS1
Repression

ADAMTS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTS1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004222
E5RI60 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
E5RI60 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
E5RJR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
E5RJR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
H7C206 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
H7C206 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C206 (UniProtKB)
IEA
GO:0001542
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0001822
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005604
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9UHI8 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007229
Q9UHI8 (UniProtKB)
TAS
GO:0008201
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008237
Q9UHI8 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008285
Q9UHI8 (UniProtKB)
TAS
GO:0010976
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0031410
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0044691
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0060347
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0071305
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0071374
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0071380
Q9UHI8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ADAMTS1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Down Syndrome 0.12272435 2 0 CTD_human_LHGDN
Liver carcinoma 0.120814326 3 0 BeFree_CTD_human
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Mammary Neoplasms 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Neoplasm Invasiveness 0.12 1 0 CTD_human
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Muscle Weakness 0.12 1 0 CTD_human
Brain Ischemia 0.082367032 2 0 GAD_RGD
Myocardial Infarction 0.080542884 3 0 BeFree_RGD
Ureteral obstruction 0.080271442 1 0 BeFree_RGD

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